TCseq包提供了一個(gè)統(tǒng)一的套件去處理不同時(shí)序類型的數(shù)據(jù)分析，可以應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄組或者像ATAC-seq，Chip-seq的表觀基因組時(shí)序型數(shù)據(jù)分析...
投稿
收錄了49篇文章 · 23人關(guān)注
-
利用TCseq包進(jìn)行基因表達(dá)趨勢分析 -
文獻(xiàn)學(xué)習(xí)008--[sc]兩篇PBMC單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blo...
-
把基因畫在染色體上之前有一次，我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”，因此，我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個(gè)需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后，最終用ggpl...
-
本地安裝UCSC基因組瀏覽器
UCSC基因組瀏覽器在大規(guī)模高通量數(shù)據(jù)的可視化和比較分析研究中發(fā)揮著重要的作用。擁有了本地瀏覽器，就可以對自己的測序數(shù)據(jù)進(jìn)行更深入的分析和共享使...
-
三維基因組（Hi-C）的原理以及應(yīng)用Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲（Chromosome Conformation Capture, 3C）技術(shù)，利用高通量測序技術(shù)，結(jié)合生物信息分...
-
RNA-seq(6): reads計(jì)數(shù)，合并矩陣并進(jìn)行注釋任務(wù) 1.實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多，還是煩請大家先自己搜索幾個(gè)教程，入門請統(tǒng)一用htseq-count，對每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件。2.需...
-
物種-樣本關(guān)系的circos圖經(jīng)常在基因組或其他組學(xué)文章中見到circos圖，但是并不知如何解讀？以及circos圖適用于哪類數(shù)據(jù)分析結(jié)果的展示？這里借助一篇推文，總結(jié)一下個(gè)...
-
mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemRNA-seq上中游分析需要用到Linux系統(tǒng)的terminal！ 盡管TCGA數(shù)據(jù)庫中已經(jīng)提供了大量的處理好的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)，但是無論是自身實(shí)...
-
一文讀懂進(jìn)化樹（圖文詳解）一、什么是進(jìn)化樹 系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹 (Phylogenetic tree)：** 一般也叫系統(tǒng)進(jìn)化樹，進(jìn)化樹。它可以利用樹狀分支圖形來表示各物種或...
-
免疫生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫匯總||Immunoinformatics Databases
通過信息技術(shù)的進(jìn)步而產(chǎn)生的大量生物技術(shù)數(shù)據(jù)，正在促進(jìn)生物系統(tǒng)知識(shí)的擴(kuò)大。 這些創(chuàng)新改變了生物醫(yī)學(xué)研究、開發(fā)和應(yīng)用的方式。 臨床數(shù)據(jù)補(bǔ)充了生物數(shù)...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1822631/logo.png', '推薦專題《生信情報(bào)站》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/01dba1bfb3a3?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}