寫在前面 這兩天有看到幾個(gè)用戶朋友在生信札記討論群中討論了基因結(jié)構(gòu)圖的繪制?？吹狡渌脩粢恢蓖扑] GSDS，我便也沒有作聲，畢竟 GSDS 確實(shí)是很優(yōu)秀的網(wǎng)頁軟件。而現(xiàn)實(shí)情況...
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TBtools | 只有序列，怎么做基因結(jié)構(gòu)圖? -
基因家族分析全套軟件
基因家族生物信息學(xué)分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增，主要有染色體片段復(fù)制、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式，可能導(dǎo)致功能丟...
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基因家族分析3 || 蛋白性質(zhì)和序列分析基因家族流程：基因家族分析（一） 基因家族流程：基因家族分析（二） =====================================================...
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TBtools | 多圖合一至強(qiáng)版教程！進(jìn)化樹 + Motifs + 結(jié)構(gòu)域 + 啟動(dòng)子 + 基因結(jié)構(gòu) + ....放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實(shí)一直懶得說。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說，也是一時(shí)興起寫出來的。開發(fā)的...
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軟件學(xué)習(xí)——模體搜索MEME-ChIPThe MEME suite 是一組功能強(qiáng)大的，基于網(wǎng)頁的集成工具，可用于研究蛋白質(zhì)，DNA 和 RNA 中的序列模體。 The MEME Suitehttps://meme...
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MEGA構(gòu)建進(jìn)化樹如何用MEGA-X構(gòu)建進(jìn)化樹_生物研究_實(shí)用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]...
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你好，我想問下我合并數(shù)據(jù)集后樣本量就變少了，是哪里出了什么問題嘛？
tassel關(guān)聯(lián)分析
一，準(zhǔn)備文件：1.hmp 12列后接樣本 2.表型形狀 第一列是樣本編號(hào)，第二列開始接表型形狀 二，啟動(dòng)tassel 三，導(dǎo)入數(shù)據(jù)hmp文件 導(dǎo)入性狀數(shù)據(jù) 轉(zhuǎn)化成tassel...
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【R>>ggprism】Graphpad Prism繪圖風(fēng)格做科研的Graphpad Prism是避不開的一道關(guān)，那么是否可以用R來實(shí)現(xiàn)其繪圖風(fēng)格呢？在微信公眾號(hào)例竟然發(fā)現(xiàn)一篇好文，《一行代碼繪制Graphpad Prism風(fēng)格學(xué)術(shù)表...
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遺傳多樣性軟件 GenAlex 使用說明GenAlexGenAlex下載地址[http://biology-assets.anu.edu.au/GenAlEx/Welcome.html]GENALEX軟件是Peak...
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相關(guān)性及PCA分析簡(jiǎn)要介紹相關(guān)性及PCA分析 1、 相關(guān)性分析 本次使用數(shù)據(jù)如下所示： 加載數(shù)據(jù) 相關(guān)性分析 結(jié)果如下 2、PCA分析 還是用上述數(shù)據(jù) 加載包 基礎(chǔ)圖形 PCA聚類,用pam函...
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大神，求回答在進(jìn)行遺傳距離之后出現(xiàn)了一下情況，是哪里除了問題？
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'<93>2<37>5.
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<p>Anderson, M.J. and Millar, R.B. (2004). Spatial variation and effects
of habitat on temperate reef fish assemblages in northeastern New
Zealand. <em>Journal of Experimental Marine Biology and Ecology</em>
305, 191–221.
</p>
<p>Anderson, M.J., Ellingsen, K.E. & McArdle, B.H. (2006). Multivariate
dispersion as a measure of beta diversity. <em>Ecology Letters</em>
9, 683–693.
</p>
<p>Anderson, M.J & Thompson, A.A. (2004). Multivariate control charts for
ecological and environmental monitoring. <em>Ecological
Applications</em> 14, 1921–1935.
</p>
<p>Cao, Y., Williams, W.P. & Bark, A.W. (1997). Similarity measure bias
in river benthic Auswuchs community analysis. <em>Water
Environment Research</em> 69, 95–106.
</p>
<p>Chao, A., Chazdon, R. L., Colwell, R. K. and Shen, T. (2005). A new
statistical approach for assessing similarity of species composition
with incidence and abundance data. <em>Ecology Letters</em> 8, 148–15基于R語言的微生物群落組成多樣性分析—β多樣性之PCoA分析
引言 ????，即主坐標(biāo)分析（Principal Coordinates Analysis），是一種用于研究樣本微生物群落組成相似性或差異性的數(shù)據(jù)降維分析方法。PC1 和PC...
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研究生一枚，主要研究方向?yàn)橹参飪?nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容，公眾號(hào)【科研后花園】，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享；3）繪圖技巧分享；4）科研網(wǎng)站分享。
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析—β多樣性之PCoA分析引言 ????，即主坐標(biāo)分析（Principal Coordinates Analysis），是一種用于研究樣本微生物群落組成相似性或差異性的數(shù)據(jù)降維分析方法。PC1 和PC...
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R數(shù)據(jù)可視化4: PCA和PCoA圖其實(shí)不論是PCoA還是PCA圖均是用散點(diǎn)圖來展示結(jié)果PCoA和PCA的結(jié)果，PCoA和PCA準(zhǔn)確來講是數(shù)據(jù)降維分析方法。順便值此佳節(jié)，祝福各位和“科研”都能夠擁有幸福時(shí)光和美...
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主成分分析（PCA）& 主坐標(biāo)分析（PCoA）——R包繪圖（2D/3D散點(diǎn)圖）導(dǎo)讀 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也稱主分量分析或主成分回歸分析法，是一種無監(jiān)督的數(shù)據(jù)降維方法。PCA通過線性變換將原始...
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群體結(jié)構(gòu)——Structure堆疊圖詳細(xì)畫法基本概念 基迪奧有篇文章寫得非常的簡(jiǎn)單明了，我這里就不再贅述，大家移步去搞清楚基本知識(shí)。 群體結(jié)構(gòu)圖形——structure堆疊圖[https://www.genedenov...
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遺傳多樣性軟件 distruct 使用說明distruct圖形的繪制需要此軟件 2. Input file 2.1 Population Q-matrix file 第一列為種群id , 這k列分別為k個(gè)struct...
