做科研的都知道開(kāi)創(chuàng)性的工作自然意義重大，但那是可遇不可求。迅速跟進(jìn)大牛們開(kāi)創(chuàng)性的思路或者方法，結(jié)合自身的研究基礎(chǔ)，做出類(lèi)似的成果無(wú)疑是個(gè)高效的策略。 早些年的轉(zhuǎn)錄組可謂是典型...
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菠蘿WRKY基因家族分析文章 -
TBtools 的 Circos 功能到底有沒(méi)有人在用？寫(xiě)在前面 久前，我在 JIGplot 中增加了極坐標(biāo)轉(zhuǎn)換功能，即掰彎。這一特性適用于 TBtools 幾乎所有輸出圖表，如熱圖，基因結(jié)構(gòu)圖，畢竟用戶都可以手動(dòng)掰彎。在實(shí)現(xiàn)這一...
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一鍵！構(gòu)建最大似然樹(shù)~ 簡(jiǎn)單又準(zhǔn)確寫(xiě)在前面 很多人都知道“建樹(shù)”，NJ樹(shù)，最大似然樹(shù) - ML，貝葉斯法建樹(shù)~ 建樹(shù)的目的常常有兩個(gè)： 分類(lèi) 推斷演化順序 其他 - 如分析基因家族擴(kuò)張收縮等 很多人都會(huì)用 m...
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TBtools | 多圖合一至強(qiáng)版教程！進(jìn)化樹(shù) + Motifs + 結(jié)構(gòu)域 + 啟動(dòng)子 + 基因結(jié)構(gòu) + ....放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實(shí)一直懶得說(shuō)。 寫(xiě)在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說(shuō)，也是一時(shí)興起寫(xiě)出來(lái)的。開(kāi)發(fā)的...
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批量下載JGI（phytozome植物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)）數(shù)據(jù)寫(xiě)在前面 今天課題組師妹與我提到，其要下載Phytozome上的所有數(shù)據(jù)。這個(gè)事情，我在早在幾年前干過(guò)。不過(guò)前年有整了一次。整體簡(jiǎn)單，以下附上之前的記錄。 2017年的記錄 ...
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全自動(dòng)分析工具 | 原核生物（基因家族）蛋白功能及進(jìn)化分析寫(xiě)在前面 Emmm，無(wú)意間看到的一個(gè)工具。從某種意義上來(lái)說(shuō)，類(lèi)似真核生物中的基因家族分析自動(dòng)化工具。當(dāng)然，差別還是有不少的。雖然我?guī)缀醪蛔鲈松锵嚓P(guān)課題，不過(guò)這個(gè)工具相信對(duì)...
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簡(jiǎn)捷 | BLAST Zone 從數(shù)據(jù)庫(kù)中直接提取序列！寫(xiě)在前面 今天周末，人在貴陽(yáng)。BLAST Zone 這個(gè)功能，我太喜歡了。寫(xiě)出來(lái)之后，基本我天天用。主要原因還是簡(jiǎn)單，他確實(shí)比以前各個(gè) BLAST GUI Wrapper 功...
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《TBtools Cookbook》- 寫(xiě)給「TBtools」所有用戶的參考手冊(cè)關(guān)于 TBtools，我們已經(jīng)聊得太多。前前后后應(yīng)該也有數(shù)百篇推文，正好對(duì)應(yīng)了 TBtools 數(shù)百個(gè)功能。我也曾經(jīng)提過(guò)，推文當(dāng)然好，但能起的作用，是宣傳。如果說(shuō)有記錄的功能...
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「Sanger Sequencing Check」系列插件支持MacOS了~寫(xiě)在前面 Emmm，寒期寫(xiě)了幾個(gè)插件： Primer Check，用于本地基于序列庫(kù)，檢測(cè)引物特異性 Sanger Sequencing Chek，用于查看測(cè)序峰圖，.ab1...
