再次體驗一下TBtools的強大。使用TBtools對基因家族進行分析，進化樹、Motifs 、結構域和基因結構多圖合一。 一、數據準備 1.基因組組裝結果fasta格式 2...
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TBtools | 基因家族分析 (進化樹、Motifs、結構域) -
引物設計原則 及 Primer Premier 6 批量引物設計本文來源：互聯網，侵權刪 篇一：引物設計原則 剛做實驗的同學，很多時候希望別人幫自己設計好引物，其實這種方式是不可取的，首先是高估了引物設計 的難度，其次也自己的實驗別人了解...
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比較基因組學之-同源基因概念
最近看文獻，有兩個詞Homologs、 Orthologs的含義總是分不清，查了一下，結果需要學習的東西越查越多。 直系同源基因 - Orthologous genes (o...
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核酸和蛋白質序列比對與序列特征分析
寫在前面，其中的一些具體原理包括算法以后或許會詳細添加。主要參考主源自李霞老師主編《生物信息學理論與醫(yī)學實踐》，陳銘《生物信息學》，馮世鵬《實用生物信息學》，冉隆科《生物信息...
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如何獲得一個基因的結構域呢？CDD數據庫的使用導師交給我一個基因，該怎么去查詢這個基因的保守結構域，以便我后續(xù)對這個基因的進一步研究呢？話不多說直接上圖： 1. NCBI中CDD數據庫的查詢和使用 打開NCBI首頁，...
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如何利用NCBI預測基因的結構域和保守位點1. 使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質或者核酸序列內的保守結構域或功能單位。該工具位于NCBI中。具體我們可以進入NCBI后選擇Conserved Domain然后...
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正向遺傳學和反向遺傳學
正向遺傳學的研究是指開始于良好表征的表型，然后鑒定影響表型的基因。即通過生物個體或細胞的基因組的自發(fā)突變或人工誘變，尋找相關的表型或性狀改變，然后從這些特定性狀變化的個體或細...
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生物基礎知識-CDS、ORF、啟動子、終止子、轉錄因子、UTR劉小澤寫于2020.2.8大概回顧一下基礎知識 一：ORF與CDS ORF：open reading frame（開放閱讀框） 它是理論上的蛋白編碼區(qū)，一般是先在DNA序列中...
