一、安裝gfold Gfold軟件是做沒有生物學(xué)重復(fù)樣本首選的軟件https://zhanglab.#edu.cn/softwares/GFOLD/index.h...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：天津
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無(wú)生物學(xué)重復(fù)的差異分析—Gfold -
沒有生物學(xué)重復(fù)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)怎么進(jìn)行差異分析？設(shè)置生物學(xué)重復(fù)這個(gè)環(huán)節(jié)也是你實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)很重要的一part，設(shè)置的好對(duì)你下游分析也有利，通常我們做轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，需要的樣本量每組至少為3個(gè)生物學(xué)重復(fù)，這個(gè)處理起來就很合理，并且現(xiàn)在...
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FPKM數(shù)據(jù)下游分析
前面分享了FPKM數(shù)據(jù)該怎么分析？后來看了一下別人分享的例子，應(yīng)該把FPKM轉(zhuǎn)換為TPM后再進(jìn)行分析。為什么說FPKM和RPKM都錯(cuò)了？簡(jiǎn)單小需求：如何將FPKM轉(zhuǎn)換成TPM...
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終止釋放-20210320 - Free！公益釋放 | 任何人都能分析 RNAseq 原始數(shù)據(jù)了，只要你用 TBtools ！寫在前面 六年前，我著實(shí)開發(fā) TBtools 的主要目的之一，即“減輕科研人員數(shù)據(jù)分析負(fù)擔(dān)”，而后慢慢變化成現(xiàn)在的“降低甚至拆除部分生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析門檻”?；谶@三五年的觀...
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R語(yǔ)言獲取數(shù)據(jù)3：導(dǎo)入Excel文件
工作中做數(shù)據(jù)分析的時(shí)候，偶爾會(huì)需要將一些 Excel 文件導(dǎo)入到R中使用，每次都轉(zhuǎn)換成 csv 文件也不現(xiàn)實(shí)，而且不管是保存成 csv 還是 txt 文件，都只能保存當(dāng)前活動(dòng)...
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生信分析學(xué)習(xí)筆記 - RNAseq （三） FastQC評(píng)估聲明：本文部分內(nèi)容和部分圖片來源于網(wǎng)絡(luò)。本文為生信小白學(xué)習(xí)筆記，不能保證專業(yè)名詞和內(nèi)容全部正確或權(quán)威。 下圖為某一條RNAseq從數(shù)據(jù)預(yù)處理，序列回帖到數(shù)據(jù)可視化...
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RNASEQ（二）: PCA主成分分析對(duì)RNAsq的read count數(shù)據(jù)進(jìn)行PCA分析 目的：PCA分析可以得到樣本之間的相關(guān)性和離散程度。 內(nèi)容：1 . 基因表達(dá)量數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化，用tpm和fpkm兩種方法...
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零代碼學(xué)生信第九天-差異分析的可視化有哪些？前面學(xué)習(xí)怎么做差異分析，差異分析的R包是需要根據(jù)數(shù)據(jù)進(jìn)行選擇的，前面我們提到了芯片數(shù)據(jù)一般用limma包做差異，高通量的二代測(cè)序如果是count數(shù)據(jù)（全是整數(shù)），可以選擇使用...
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基因編輯改造的NK-92細(xì)胞功能變得如此強(qiáng)大！自然殺傷（NK）細(xì)胞由獨(dú)特的先天淋巴樣細(xì)胞群組成，具有多種細(xì)胞毒性機(jī)制和通過細(xì)胞因子調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)的能力，在抗癌免疫中扮演著關(guān)鍵角色[1]。在過去的五十年中，NK細(xì)胞的重要性和...
