IP屬地：貴州
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Neoantigen Prediction
High-resolutionHLA typingwas performed computationally usingSOAP-HLA fro...
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TCR CPK
T細胞(TCR)克隆多樣性的指標(CPK) 一、CPK是什么 CPK就是一個衡量，T細胞(TCR)克隆多樣性的指標[Ref1]。它越高就說明文庫...
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TCRTRUST 1、概述 TRUST，是從RNA-seq原始數(shù)據(jù)組裝到TCR CDR3的軟件，專門為RNA-seq數(shù)據(jù)設計的工具[Ref1]。 它是...
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HLA Typing# 函數(shù)功能簡介：使用HLA-HD軟件來識別HLA typing # 創(chuàng)建作者: Van Linun # 日期：2020/9/7 #######...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 7 pVACSeq pVACtools pVACtool是一個癌癥免疫治療工具套件，由四個工具組成，分別是pVACseq、pVACfu...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 6 VATools 簡介 VAtools是一個包含多個注釋VCF文件工具的python模塊。VAtools 包含vcf-readcou...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 5 VEP 簡介 VEP(Variant Effect Predictor)是ENSEMBL制作的一個專門對突變數(shù)據(jù)添加注釋信息的工具...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 3 Samtools view view命令的主要功能是：將sam文件轉換成bam文件；然后對bam文件進行各種操作，比如數(shù)據(jù)的排序(...
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WES2Neoantigen Pipeline
Part 2 BWA 一、建立索引 $ bwa index -a bwtsw human.fa -a [is|bwtsw] : 輸入構建Inde...