前言 基因測序已是時下熱門,目前除了華大基因之外,其他分布于全中國的大型測序平臺(HiSeq X 10)還有約10個,每個每年大概能完成1.8萬人的高深度全基因組測序,加起來...
索引構(gòu)建 構(gòu)建好索引后,第一次比對 構(gòu)建二次比對的新索引: PSSTAR緩存文件太大,7TB空間run 190個RNA-seq都吃不消,還是用For循環(huán)來做。
安裝這個Trim Galore軟件上之前需要安裝好Fastqc和cutadapt兩個軟件: 1. 安裝Fastqc wget http://www.bioinformatic...