假設(shè)檢驗(yàn)： 一般步驟： 1.設(shè)定假設(shè)后需要驗(yàn)證：假設(shè)0一般都是“處理組和對(duì)照組無(wú)區(qū)別” 2.構(gòu)建檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量：根據(jù)樣本數(shù)據(jù)計(jì)算統(tǒng)計(jì)量和檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量 3.設(shè)定置信區(qū)間：根據(jù)檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)...
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【點(diǎn)】p value、FDR、q value
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p.value和FDR最近用limma作差異分析，接觸p.value和adj.p.value比較多，今天就重點(diǎn)解釋下p.value和FDR吧： 在topTable函數(shù)的結(jié)果里，我們都會(huì)看到p.va...
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@xiami554 感謝感謝，當(dāng)時(shí)下載了好多次都還是報(bào)錯(cuò)，但最后我用這里的方法解決了。
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzA2MTcwMg==&;mid=2650736922&idx=1&sn=e754b2933fe2d413b1c2f8fa75651ec7&chksm=f0285ab3c75fd3a5525b9fc61c68c6085f4adbd2617d8c736342085a3a5628b3357cca90fb64&scene=132&exptype=timeline_recommend_article_extendread_samebiz#wechat_redirectR錯(cuò)誤 Shadow graphics device error: r error 4
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
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你好，請(qǐng)問(wèn)一下，我在更新R后，安裝clusterprofiler時(shí)一直出現(xiàn) ”不存在叫‘HPO.db’這個(gè)名字的程輯包“，不知道樓主有沒(méi)有碰到過(guò)類似情況呢？感謝
R錯(cuò)誤 Shadow graphics device error: r error 4
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
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R錯(cuò)誤 Shadow graphics device error: r error 4
我的R在版本由4.2.2更新4.3.1后使用remotes::install_github("YuLab-SMU/HPO.db") BiocManager::install(...
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KEGG注釋：KEGG富集可視化柱狀圖很久很久以前，看到過(guò)文章中的KEGG富集可視化結(jié)果圖。是對(duì)KEGG通路進(jìn)行注釋的。后來(lái)在一些測(cè)序公司的宣傳頁(yè)上也見到過(guò)類似的圖： 其實(shí)這個(gè)圖就是多了一個(gè)KEGG通路注釋，近期...
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【R語(yǔ)言】卡方檢驗(yàn)和Fisher精確檢驗(yàn)，復(fù)現(xiàn)臨床paper做臨床數(shù)據(jù)分析的時(shí)候我們經(jīng)常會(huì)用卡方檢驗(yàn)或者Fisher精確檢驗(yàn)去看看不同的臨床特征在兩組里面有沒(méi)有顯著差異。今天小編就帶大家來(lái)重現(xiàn)一下下面這篇paper的Table2 Ta...
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老大醒腦題-我卻迷糊了
問(wèn)題鏈接看http://www.bio-info-trainee.com/4458.html 我碰到的問(wèn)題 1.要不要把每個(gè)list變成data.frame,我給變成了，我首...
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù) mRNA芯片分析全流程GEO數(shù)據(jù)庫(kù) mRNA芯片分析全流程 我們演示的數(shù)據(jù)集是GSE19136，樣本可分為三組（對(duì)照組，支架組，紫杉醇組），具體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)情況請(qǐng)查看鏈接。本篇文章主要對(duì)對(duì)照組和支架組...
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歡迎關(guān)注公眾號(hào) “生信交流平臺(tái)”
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GEO芯片數(shù)據(jù)差異表達(dá)分析前面簡(jiǎn)單給大家介紹過(guò) GEO數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)檢索方法（一）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4ODE0NTE3OA==&mid=2649210...
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一個(gè)GSE有兩個(gè)GPL該怎么辦莎莎寫于2020.5.7?今天上午10點(diǎn)鐘準(zhǔn)時(shí)就醒了，然后和室友磨嘰半天去實(shí)驗(yàn)室打掃衛(wèi)生，然后簽了字就偷偷溜了??然后回到中校區(qū)買了超級(jí)甜的哈密瓜??還有火龍果，沃柑，一共是30...
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R語(yǔ)言中的連接dplyr中的join系列與merge函數(shù)
在數(shù)據(jù)分析過(guò)程中，僅僅涉及一張表格的情況是非常少見的，我們經(jīng)常需要聯(lián)系到其它表格的數(shù)據(jù)，整合這些表格的信息。這時(shí)我們需要常見的三類操作來(lái)完成。 合并連接：根據(jù)觀測(cè)合并表格 篩...
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@天涯清水 還有一個(gè)疑問(wèn)，這樣做出來(lái)的結(jié)果就夠了么？我看別人的文章中最后還會(huì)加一個(gè)統(tǒng)計(jì)分析的結(jié)果，請(qǐng)問(wèn)大佬知道咋弄的么？
細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費(fèi)軟件）
細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費(fèi)軟件） 細(xì)胞周期，是指細(xì)胞從一次分裂完成開始到下一次分裂結(jié)束所經(jīng)歷的全過(guò)程，分為間期與分裂期兩個(gè)階段。細(xì)胞間期又分為C0期、...
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細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費(fèi)軟件）細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費(fèi)軟件） 細(xì)胞周期，是指細(xì)胞從一次分裂完成開始到下一次分裂結(jié)束所經(jīng)歷的全過(guò)程，分為間期與分裂期兩個(gè)階段。細(xì)胞間期又分為C0期、...
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大佬，能再分享下軟件么？感激不盡
細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費(fèi)軟件）
細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)：從protocol到數(shù)據(jù)分析（附免費(fèi)軟件） 細(xì)胞周期，是指細(xì)胞從一次分裂完成開始到下一次分裂結(jié)束所經(jīng)歷的全過(guò)程，分為間期與分裂期兩個(gè)階段。細(xì)胞間期又分為C0期、...
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引物設(shè)計(jì)引物設(shè)計(jì)——QPCR 一、序列查找 參考漢恒生物技術(shù)文檔 常用數(shù)據(jù)庫(kù) NCBI-GeneBank Nucleotide Gene NCBI不多做介紹。NC表示人類基因組DNA...
