這個(gè)世界流行離開(kāi)，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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@jijitoutou 額，tpm為啥需要標(biāo)準(zhǔn)化，tpm每個(gè)樣本的和相等，還需要再標(biāo)準(zhǔn)化一次嗎
Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的區(qū)別
1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度：某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到。一般而言，隨著測(cè)序深度的增加，基因種類以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...
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一般細(xì)胞群足夠多，并且不在細(xì)分
clustree ： 聚類可視化利器
我們知道在研究問(wèn)題時(shí)，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類（clustering）...
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clustree ： 聚類可視化利器我們知道在研究問(wèn)題時(shí)，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類（clustering）...
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努力努力再努力~<br>個(gè)人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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暫別簡(jiǎn)書，后會(huì)有期
我不是老師，也不是大神，更不是前輩。我只是個(gè)普通的科研工作者，一個(gè)只想努力變得更好的人。 來(lái)到簡(jiǎn)書快3年了，期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙摹Ｖ两?..
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count normalization的方法
count normalization的方法 這應(yīng)該會(huì)是一個(gè)小系列，我會(huì)簡(jiǎn)單介紹下現(xiàn)在的一些count normaliztion的方法，以及對(duì)應(yīng)的代碼解釋、思考，從而最后得出...
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Python黑科技系列11-自動(dòng)化工具破解VIP付費(fèi)文章下載數(shù)據(jù)序言 不要懼怕還未到來(lái)的結(jié)果，要堅(jiān)信，人生那么長(zhǎng)，執(zhí)著努力的人，一定會(huì)被時(shí)光溫柔以待。愿一切為之努力的事情，都有浪漫的結(jié)果。不動(dòng)聲色地變好，每一天都要比昨天更加好。僅此一生，...
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單細(xì)胞的GO KEGG GSEA GSVA分析今天抽個(gè)空把單細(xì)胞領(lǐng)域的GO KEGG GSEA GSVA都做了一遍，跑完以后的感覺(jué)就是有這樣的理解，就是單細(xì)胞我首先會(huì)選擇做GSVA，但是我還會(huì)順便做下kegg或者GSEA...
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周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹(shù)。生信技能樹(shù)核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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哪個(gè)更好呢
Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的區(qū)別
1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度：某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到。一般而言，隨著測(cè)序深度的增加，基因種類以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...
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Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的區(qū)別1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度：某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到。一般而言，隨著測(cè)序深度的增加，基因種類以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...
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跟著Science Advances學(xué)畫圖：R語(yǔ)言ggplot2畫圖如何讓坐標(biāo)軸以科學(xué)計(jì)數(shù)法顯示今天的推文是昨天推文的延續(xù)。在昨天的推文中模仿了論文 Landscapes of bacterial and metabolic signatures and their i...
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