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發(fā)簡信
IP屬地：湖北
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堂姐裝瘋賣傻，真成了傻子
堂姐犯了錯，喜歡用裝瘋賣傻來逃避責(zé)罰。 爸媽說她身世可憐又精神不好，總逼我讓著她。 于是，堂姐做事越發(fā)過分。 不僅盯上了我男朋友，還想要我的命。 可她不知道，我綁定有懲罰系統(tǒng)...
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MCScanX安裝與使用 (2022)為什么要寫這篇文章：最近因為需要用到MCScanX畫兩個物種的共線性點(diǎn)圖，但是發(fā)現(xiàn)搜到的blog中所提供的安裝方法都不太相同，且在都會出現(xiàn)或多或少的問題，另外搜到的所有blo...
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祖先狀態(tài)重建—揭示物種性狀的起源與演化我覺得處理任何事情，不僅要做到“知其然”，還要做到“知其所以然”。在做事情時，如果僅知道低頭蠻干，不知道抬頭看路；只知道跟著“牽牛繩”的方向，在鞭子的抽打下前進(jìn)或停止，那么最...
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大量測序數(shù)據(jù)上傳NCBI方法1、把要上傳的數(shù)據(jù)整理在一個文件夾里。 2、用NCBI賬號或ORCiD、Microsoft、Google賬號登陸，選擇Submit，向下滾動，找到Sequence Read ...
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請問JuncBASE軟件怎么安裝呀？
三代測序人物系列 | Angela N. Brooks
在做三代測序全長轉(zhuǎn)錄組分析工具調(diào)研時，記錄一些和三代測序工作相關(guān)的實驗室和PI，那就先從開發(fā)FLAIR軟件的實驗室開始吧！ Angela N. Brooks 教授 Brook...
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三代測序人物系列 | Angela N. Brooks在做三代測序全長轉(zhuǎn)錄組分析工具調(diào)研時，記錄一些和三代測序工作相關(guān)的實驗室和PI，那就先從開發(fā)FLAIR軟件的實驗室開始吧！ Angela N. Brooks 教授 Brook...
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生信步驟|Orthofinder尋找直系同源基因
在探究功能基因的時候，我們經(jīng)常需要對所研究的基因/蛋白質(zhì)進(jìn)行聚類分組，逐個類群探究蛋白功能。創(chuàng)建同源群可以采用Otrhofinder軟件，該軟件安裝方便，運(yùn)行快速，調(diào)用簡單，...
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生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程
最近Orthofinder2開始陸續(xù)更新，文章已經(jīng)投發(fā)到biorkix上，在網(wǎng)上搜了一圈，關(guān)于Orthofinder的使用的中文教程幾乎是空白的，這周就借此機(jī)會和大家一起來學(xué)...
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phylophlan3使用(更新)
下載、安裝 軟件運(yùn)行配置文件無需基因組fna或者faa文件基因組是fna，配置文件（下一步速度慢，不推薦） 基因組翻譯后的faa（速度更快，推薦使用），配置文件。 參數(shù) -o...
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2021-03-02上古軟件silix的安裝因為項目需要，安裝一個非常古老的軟件 silix，想要安裝的版本1.2.9已經(jīng)是14年的產(chǎn)物了。網(wǎng)址：http://lbbe.univ-lyon1.fr/-SiLiX-?la...
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使用GEMMA進(jìn)行復(fù)雜性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件（文獻(xiàn)信息...
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【群體遺傳】選擇信號分析-Fst、Pi1.選擇信號分析—Fst選擇信號分析 概念 Fst：群體間遺傳分化指數(shù)，是種群分化和遺傳距離的一種衡量方法，分化指數(shù)越大，差異越大。適用于亞群體間多樣性的比較。 用于衡量種群...
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生物基礎(chǔ)知識-CDS、ORF、啟動子、終止子、轉(zhuǎn)錄因子、UTR劉小澤寫于2020.2.8大概回顧一下基礎(chǔ)知識 一：ORF與CDS ORF：open reading frame（開放閱讀框） 它是理論上的蛋白編碼區(qū)，一般是先在DNA序列中...
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GTDB基因組分類數(shù)據(jù)庫及GTDB-Tk工具Introduction GTDB（Genome Taxonomy Database）是一個專注于基因組分類學(xué)的數(shù)據(jù)庫，旨在提供高質(zhì)量的細(xì)菌、古細(xì)菌、葉綠體和線粒體的分類信息...
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「生信」同源基因分析——OrthoMCL目錄介紹環(huán)境配置OrthoMCL使用統(tǒng)計聚類結(jié)果最后 介紹 OrthoMCL是一款直系同源基因聚類軟件, 它不僅能得到多個物種共有的直系同源基因, 還能夠分別獲得不同物種特有...