Jiang, Y. Z., Ma, D., Suo, C., Shi, J., Xue, M., Hu, X., ... & Shao, Z. M. (2019). Geno...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河南
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2022-04-04 復(fù)旦邵志敏教授團(tuán)隊(duì)三陰性乳腺癌分型和治療兩篇 -
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2023-04-15簡(jiǎn)書(shū)平臺(tái)不再更新
當(dāng)初在簡(jiǎn)書(shū)平臺(tái)更內(nèi)容一方面是出于搜索方便，另外一方面我自己在簡(jiǎn)書(shū)學(xué)到很多東西，多少想回饋一下，現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)簡(jiǎn)書(shū)也開(kāi)始有亂七八糟的廣告了，而且審核太嚴(yán)， 莫名其妙，數(shù)據(jù)也不行。今日...
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一個(gè)暴露對(duì)應(yīng)所有結(jié)局-孟德?tīng)栯S機(jī)化研究發(fā)nature communications大家好，好久不見(jiàn)。休息了一段時(shí)間，同時(shí)去找工作去啦！今天我們來(lái)看一篇難度不高，但是工作量不算小的文章，同時(shí)學(xué)習(xí)一下怎么提升自己孟德?tīng)栯S機(jī)化研究的level。文章：Geneti...
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孟德?tīng)栯S機(jī)化數(shù)據(jù)處理——染色體位置信息怎么轉(zhuǎn)換為SNP今天更完就休息幾天啦。GWAS數(shù)據(jù)在作為孟德?tīng)栯S機(jī)化暴露或者結(jié)局?jǐn)?shù)據(jù)時(shí)，偶爾也會(huì)遇到一些坑，比如說(shuō)有些數(shù)據(jù)只有染色體以及位置信息，并沒(méi)有SNP號(hào)，這個(gè)時(shí)候就比較尷尬，所以我們...
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PheWAS是什么？怎么跟孟德?tīng)栯S機(jī)化結(jié)合發(fā)高分SCI？PheWAS即看一個(gè)SNP對(duì)所有疾病可能的影響，也是一種非常有趣的、可以用公開(kāi)數(shù)據(jù)、四兩撥千斤的研究方法，也是一種類(lèi)似meta分析的方法。今天我們來(lái)看一篇用某個(gè)SNP代理基因...
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一定發(fā)高分SCI——用孟德?tīng)栯S機(jī)化評(píng)估腸道菌群對(duì)疾病的因果影響大家好，所謂科研界自古以來(lái)就有一句話：遇事不決，腸道菌群。當(dāng)然，我可能不太懂腸道菌群或者16S測(cè)序，但多少懂點(diǎn)孟德?tīng)栯S機(jī)化，今天我們來(lái)看一篇用腸道菌群做暴露，用孟德?tīng)栯S機(jī)化做...
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孟德?tīng)栯S機(jī)化發(fā)高分SCI必備的一些基本概念及計(jì)算-MAF
大家好，孟德?tīng)栯S機(jī)化很多人都是從TwoSampleMR包入手學(xué)習(xí)的，很多GWAS的概念如果不搞清楚，寫(xiě)SCI的時(shí)候容易犯一些概念性的錯(cuò)誤，低分的雜志可能大家都很水，可能也就一...
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論孟德?tīng)栯S機(jī)化與單細(xì)胞聯(lián)合研究的可能性因?yàn)槲易约貉芯康念I(lǐng)域跨單細(xì)胞、QTL、以及孟德?tīng)栯S機(jī)化，所以就一直在思考這個(gè)問(wèn)題：?jiǎn)渭?xì)胞能不能和孟德?tīng)栯S機(jī)化聯(lián)合起來(lái)研究？ 這方面的文章或者研究比較少。兩個(gè)組學(xué)能夠聯(lián)合我能想...
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單細(xì)胞去卷積怎么制作基因在細(xì)胞類(lèi)型中的系數(shù)表
上一次我們聊了去卷積的話題，去卷積就是把一個(gè)完整的東西解構(gòu)為n個(gè)特征，如一個(gè)小狗=鼻子*1+眼睛*2+有毛等。在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中，好像最早的去卷積就是CIBERSORT或者ssG...
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有的LP就是-log10（P）,有的數(shù)據(jù)直接給到P
孟德?tīng)栯S機(jī)化GWAS完整的VCF文件列名都是什么意思
大家好，好久不見(jiàn)，這個(gè)公眾號(hào)目前只有我在寫(xiě)，所有更新隨心所欲，想起來(lái)什么就發(fā)點(diǎn)啥，也不為掙錢(qián)，希望能跟大家分享一些自己在生信學(xué)習(xí)中的感受。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來(lái)...
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去卷積是什么？在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中怎么用1？個(gè)人簡(jiǎn)單理解大家好，好久不見(jiàn)，公眾號(hào)目前只有我一個(gè)人在寫(xiě)，隨心情更新。之前一直在說(shuō)孟德?tīng)栯S機(jī)化的話題，今天聊聊單細(xì)胞。很多我已經(jīng)習(xí)以為常的東西可能很多人完全不懂，或者看見(jiàn)這一類(lèi)題材就怵，...
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從一篇11分論文看怎么使用公共數(shù)據(jù)發(fā)高分SCI-2
大家好，公眾號(hào)目前只有我一個(gè)人在寫(xiě)，隨心情更新?，F(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來(lái)越卷了，而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn)，對(duì)我們這種臨床gou特別不友好。那么有沒(méi)有不用做實(shí)...
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從一篇11分SCI看孟德?tīng)栯S機(jī)化怎么發(fā)高分大家好，好久不見(jiàn)，現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來(lái)越卷了，而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn)，對(duì)臨床gou特別不友好。那么有沒(méi)有不用做實(shí)驗(yàn)還可以發(fā)高分的文章呢？答案很明確，是...
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想不做實(shí)驗(yàn)發(fā)高分SCI？來(lái)學(xué)QTL吧現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來(lái)越卷了，而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn)，對(duì)臨床gou特別不友好。那么有沒(méi)有不用做實(shí)驗(yàn)還可以發(fā)高分的文章呢？答案很明確，是有的，我可以列出一...
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孟德?tīng)栯S機(jī)化GWAS完整的VCF文件列名都是什么意思大家好，好久不見(jiàn)，這個(gè)公眾號(hào)目前只有我在寫(xiě)，所有更新隨心所欲，想起來(lái)什么就發(fā)點(diǎn)啥，也不為掙錢(qián)，希望能跟大家分享一些自己在生信學(xué)習(xí)中的感受。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來(lái)...
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GWAS分析-P值和beta值的愛(ài)恨相殺 (六)前面已經(jīng)簡(jiǎn)單介紹過(guò)GWAS的概念，GWAS分析中所用到的文件以及分析流程，我們?cè)贕WAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會(huì)看到beta值和P值，他們分別代表什么意思？這兩個(gè)值又有什么關(guān)系呢...
