一、測(cè)序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備 新建工作目錄,GATK-analysis 新建data文件夾;mkdir data 1.1 公司返回的測(cè)序下機(jī)數(shù)據(jù) 例如:6個(gè)NGS測(cè)序樣本;Raw da...
一、測(cè)序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備 新建工作目錄,GATK-analysis 新建data文件夾;mkdir data 1.1 公司返回的測(cè)序下機(jī)數(shù)據(jù) 例如:6個(gè)NGS測(cè)序樣本;Raw da...
1摘要部分 起初,大芻草進(jìn)化而來(lái)的玉米是短日照,在短日條件下開(kāi)花,長(zhǎng)日照條件下花期推遲甚至不開(kāi)花。通過(guò)定位克隆和關(guān)聯(lián)定位,將一個(gè)花期數(shù)量性狀位點(diǎn)確定位于CCT轉(zhuǎn)錄因子(ZmC...
參考學(xué)習(xí)自公眾號(hào):細(xì)胞全能型與再生 玉米雄穗每個(gè)分支上有多個(gè)小花,每朵小花又包含一朵較大的上位花和一朵較小的下位花。通常上位花比下位花在發(fā)育進(jìn)程上早一天。每朵上/下位花分別含...
一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖:包鏈接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖,僅僅需要三列即可:a. 第...
拖拖拉拉用了一年時(shí)間才把GWAS整個(gè)流程捋完,從背景到code、還有過(guò)程中遇到的一些bug以及解決辦法,加起來(lái)也有二十余篇,按分析的流程整理出一份清單,也許以后有新的方法或者...
1、該軟件的使用需要在java環(huán)境內(nèi),下載java并安裝 https://download.oracle.com/java/18/latest/jdk-18_windows-...