一、測(cè)序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備 新建工作目錄，GATK-analysis 新建data文件夾；mkdir data 1.1 公司返回的測(cè)序下機(jī)數(shù)據(jù) 例如：6個(gè)NGS測(cè)序樣本；Raw da...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：西藏
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GATK做變異檢測(cè)
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QTL定位方法及花期文章閱讀記錄11摘要部分 起初，大芻草進(jìn)化而來(lái)的玉米是短日照，在短日條件下開(kāi)花，長(zhǎng)日照條件下花期推遲甚至不開(kāi)花。通過(guò)定位克隆和關(guān)聯(lián)定位，將一個(gè)花期數(shù)量性狀位點(diǎn)確定位于CCT轉(zhuǎn)錄因子(ZmC...
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玉米花粉發(fā)育相關(guān)過(guò)程
參考學(xué)習(xí)自公眾號(hào)：細(xì)胞全能型與再生 玉米雄穗每個(gè)分支上有多個(gè)小花，每朵小花又包含一朵較大的上位花和一朵較小的下位花。通常上位花比下位花在發(fā)育進(jìn)程上早一天。每朵上/下位花分別含...
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繪制 SNP 密度圖一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖，僅僅需要三列即可：a. 第...
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
拖拖拉拉用了一年時(shí)間才把GWAS整個(gè)流程捋完，從背景到code、還有過(guò)程中遇到的一些bug以及解決辦法，加起來(lái)也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清單，也許以后有新的方法或者...
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PGDspider的使用1、該軟件的使用需要在java環(huán)境內(nèi)，下載java并安裝 https://download.oracle.com/java/18/latest/jdk-18_windows-...
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