AlphaFold2 是由 DeepMind 在 2020 年提出的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型，其核心是通過深度學(xué)習(xí)技術(shù)從氨基酸序列預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)，并在 CASP14（Crit...
IP屬地：貴州
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AlphaFold2 解讀 -
RF Diffusion
范式再顛覆 | RF Diffusion最強(qiáng)擴(kuò)散式蛋白設(shè)計(jì)模型 - 知乎[https://zhuanlan.zhihu.com/p/588535554] RFdiffusio...
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小明你好，我在做計(jì)算EAPC的時(shí)候發(fā)現(xiàn)回歸公式里面的year是沒有定義的，所以系統(tǒng)會(huì)報(bào)錯(cuò)
疾病負(fù)擔(dān)研究（GBD）-如何優(yōu)雅的展示發(fā)病率數(shù)據(jù)
如需要加入GBD數(shù)據(jù)交流群，請(qǐng)加小編微信“Endoscopy_1991”,小編拉你進(jìn)群 本文是GBD的第三篇推文，今天我們就以已經(jīng)發(fā)表的高分GBD文章來看下如何展...
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NextFlow用法1--基本概念基本概念 Nextflow是一個(gè)反應(yīng)式工作流框架和編程DSL，可以簡(jiǎn)化數(shù)據(jù)密集型pipelines的編寫。 它的設(shè)計(jì)理念是Linux平臺(tái)是數(shù)據(jù)科學(xué)的通用語言。Linux提供了...
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bcl2fastq 產(chǎn)生的多個(gè)lane 的fastq.gz 合并
bcl2fastq 產(chǎn)生的文件結(jié)果如下（4個(gè)lane fastq.gz 文件）： 現(xiàn)在要將多個(gè)lane 的fastq.gz合并，方便下步驟的分析。 方法1： 方法1： 結(jié)果分...
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跟著Nature Genetics學(xué)畫圖：R語言ggbio包畫基因結(jié)構(gòu)圖論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...
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用R進(jìn)行microarray分析（1）Introduction 目前主流的表達(dá)譜芯片有兩類：（1）cDNA microarray：將100~5,000bp的cDNA固載到介質(zhì)上 (例如玻璃)，Stanford開發(fā)...
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這個(gè)好棒，就是我筆記本沒有Python，我感覺好像不用這么復(fù)雜
R語言GOplot畫弦圖展示GO富集分析的結(jié)果之如何準(zhǔn)備自己的數(shù)據(jù)
我們首先運(yùn)行幫助文檔里的例子看例子里畫圖用到的數(shù)據(jù)是什么樣子的 查看幫助文檔 運(yùn)行示例數(shù)據(jù)獲得畫弦圖的數(shù)據(jù) 把這個(gè)示例數(shù)據(jù)寫出到csv文件里 作圖的數(shù)據(jù)是這樣的，我們模仿這個(gè)...
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R語言GOplot畫弦圖展示GO富集分析的結(jié)果之如何準(zhǔn)備自己的數(shù)據(jù)我們首先運(yùn)行幫助文檔里的例子看例子里畫圖用到的數(shù)據(jù)是什么樣子的 查看幫助文檔 運(yùn)行示例數(shù)據(jù)獲得畫弦圖的數(shù)據(jù) 把這個(gè)示例數(shù)據(jù)寫出到csv文件里 作圖的數(shù)據(jù)是這樣的，我們模仿這個(gè)...
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R語言ggplot2作圖一些好看的顏色搭配這些顏色來自于網(wǎng)頁鏈接 https://www.royfrancis.com/elegant-scientific-graphs-learning-from-examples...
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@小潔忘了怎么分身 哈哈，現(xiàn)在也來得及
在火山圖上標(biāo)記基因
要玩圖，離不開哈德雷大神的《R數(shù)據(jù)科學(xué)》，第1章和21章是專門講圖的，我寫過對(duì)應(yīng)的筆記：http://www.itdecent.cn/p/4a154f6f0de7https...
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「摸魚快報(bào)004」讓R自己告訴你：我運(yùn)行完啦你是否經(jīng)常查看大型的R腳本是否運(yùn)行完而盯著屏幕看了一夜？你是否經(jīng)常程序跑掛了也不知道傻傻的等了一夜第二天一查看才發(fā)現(xiàn)運(yùn)行到五分鐘的時(shí)候就報(bào)錯(cuò)停止了？反正我經(jīng)常有！所以今天安利...
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conda create 過程中可能遇到的問題
在conda創(chuàng)建環(huán)境過程中，最常見的問題有幾種1、鏡像源的問題中科大的鏡像好像有問題，需要把鏡像源修改為清華源2、網(wǎng)絡(luò)的問題An HTTP error occurred wh...
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聽完直播、實(shí)際操作、再來看帖子，寫得真的好完整，我就是那個(gè)問題1.。。。??
conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）
有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了。前兩天有個(gè)胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了。前兩天有個(gè)胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
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我好喜歡他，他的code很多都好用，哈哈哈
「摸魚快報(bào)007」來自哈佛大學(xué)教授的一噸單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)資料
「摸魚快報(bào)007」來自哈佛大學(xué)教授的一噸單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)資料 摸魚快報(bào)是一檔我拍腦袋想出來的致力于輕量化地將外網(wǎng)的優(yōu)質(zhì)生物信息學(xué)及相關(guān)領(lǐng)域資料帶給大家的小欄目, 力求廢話不多...
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@李毛毛_ac31 認(rèn)真檢查一下代碼，這好久的事情了，我記得是指你的data沒有一一對(duì)應(yīng)。我用的就是小潔老師的方法二
p + geom_label_repel(aes(label = CRC),
size = 3,
data = totalgene,
segment.color = '#cccccc',
segment.size = 0.5,
force = T,
color = "#ABB065",
box.padding=unit(0.35, "lines"),
point.padding=unit(0.5, "lines"))在火山圖上標(biāo)記基因
要玩圖，離不開哈德雷大神的《R數(shù)據(jù)科學(xué)》，第1章和21章是專門講圖的，我寫過對(duì)應(yīng)的筆記：http://www.itdecent.cn/p/4a154f6f0de7https...
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剛好今天遇到這問題，謝謝解答
bam轉(zhuǎn)fastq一直WARNING，并且兩個(gè)fastq結(jié)果文件都是空的
下面這個(gè)報(bào)錯(cuò)信息較常見，但是如果每一條bam記錄都是這樣，就不常見了，我這兩天遇到了這種情況。先看看正常情況下是如何報(bào)錯(cuò)的： WARNING: Query SRR328680...
