發(fā)簡信
IP屬地：湖北
-
轉(zhuǎn)錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
-
RNA-seq入門實戰(zhàn)（一）：上游數(shù)據(jù)下載、格式轉(zhuǎn)化和質(zhì)控清洗本節(jié)概覽：1.在文章中找到 GEO accession number, 從NCBI獲取數(shù)據(jù)SRR號2.在linux中使用prefetch命令根據(jù)SRR號下載SRA文件3.使用...
-
常規(guī)RNAseq分析流程與問題歸納
-
基因組數(shù)據(jù)的重測序分析我通過查資料獲得已知達松維爾擬諾卡氏菌亞種（cardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei）的基因組原始測序序列，我想知道這個亞種與達...
-
生物軟件4-Multiqc整合多個質(zhì)控結(jié)果Multiqc安裝 安裝conda conda下載網(wǎng)址：https://docs.anaconda.com/anaconda/install/linux/[https://d...
-
SRAtoolkit安裝步驟SRAtoolkit是NCBI開發(fā)的一個用于SRA文件處理的軟件包，包含許多有用的工具。 SRAtoolkit安裝步驟 Step 1：下載SRAtoolkit軟件包 軟件包下...
-
-
-
利用動態(tài)規(guī)劃（DP）進行全局比對（二）在利用動態(tài)規(guī)劃（DP）進行全局比對（一）中淺顯的探討了動態(tài)規(guī)劃的中心思想以及如何使用動態(tài)規(guī)劃方法來解決問題。在本文將簡要的介紹早期生物信息學中是如何利用動態(tài)規(guī)劃方法來進行序列...
-
從零開始完整學習全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第1節(jié) DNA測序技術(shù)前言 基因測序已是時下熱門，目前除了華大基因之外，其他分布于全中國的大型測序平臺（HiSeq X 10）還有約10個，每個每年大概能完成1.8萬人的高深度全基因組測序，加起來...
-
Linux基礎(chǔ)（一）
Linux根目錄 /：根目錄，一般根目錄下只存放目錄，當你在終端里輸入“/home“，表示先從根目錄開始，再進入到home目錄。/bin: /usr/bin: 可執(zhí)行二進制文...
-
Multiqc整合多個質(zhì)控結(jié)果2022-09-24首先配置環(huán)境安裝conda安裝python2 安裝conda并運行 wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021...
-
R可視化——圖形繪制過程中如何實現(xiàn)局部放大？數(shù)據(jù)及基礎(chǔ)圖形的繪制 1、數(shù)據(jù)——以R自帶數(shù)據(jù)集iris為例 2、基于ggplot2包繪制散點圖 局部放大效果的實現(xiàn) 1、加載包——主要基于ggforce包實現(xiàn)圖形的局部放大...
-
利用r語言實現(xiàn)DNA雙序列全局比對（Needleman-wunsch算法)序列比對實驗報告 一．實驗內(nèi)容 1.利用序列比對線上工具做序列比較2.Blast線上工具使用3.使用r語言實現(xiàn)Needleman-Wunsch算法 二．實驗目的 1.掌握序列...
