生信阿拉丁，為實(shí)用而生
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：西藏
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MUMMER 兩個(gè)基因組間比較MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測(cè)序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長(zhǎng)度，所以一般都是逐個(gè)基因的比較，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...
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張紅祥，中國(guó)科學(xué)院植物研究所。<br>交流，分享。
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序列比對(duì)軟件 MUMmer 結(jié)果文件解讀（三）該系列主要介紹了 MUMmer 軟件下核苷酸序列比對(duì)程序 nucmer 的使用，計(jì)算操作見前兩篇推文； 序列比對(duì)軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...
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淺解NUMA機(jī)制導(dǎo)讀 本文適合知道NUMA這個(gè)詞但想進(jìn)一步了解的新手。 以下的文章內(nèi)容包括：NUMA的產(chǎn)生背景，NUMA的架構(gòu)細(xì)節(jié)和幾個(gè)上機(jī)演示的例子。 NUMA的誕生背景 在NUMA出現(xiàn)之...
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生物數(shù)據(jù)格式 - SAM/BAM格式 sam文件是短序列比對(duì)生成的文件，是二代測(cè)序中最核心的文件。在RNAseq，變異檢測(cè)等分析中，都需要首先生成sam文件格式。bam文件是sam格式的二進(jìn)制格式，轉(zhuǎn)換為二...
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5 分鐘入門 Google 最強(qiáng)NLP模型：BERTBERT (Bidirectional Encoder Representations from Transformers) 10月11日，Google AI Languag...
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轉(zhuǎn)錄組分析(1) - 基礎(chǔ)介紹轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)，廣義上指某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合。轉(zhuǎn)...
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中國(guó)科學(xué)院遺傳發(fā)育所 生物信息學(xué)博士<br>專注于基因組組裝和群體重測(cè)序研究
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個(gè)流程，并提供了基本的命令，用到的軟件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等，在此分享出來...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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SAMtools: SAM格式的處理利器SAM及其相關(guān)工具 SAM格式介紹 SAM全稱是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比對(duì)或聯(lián)配數(shù)據(jù)的格式。無論是重測(cè)序，還是轉(zhuǎn)錄組，還是表觀組，...
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samtools的安裝和使用--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具合集。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
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簡(jiǎn)書太垃圾了，已經(jīng)棄用，改用語雀
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迷戀高質(zhì)量代碼的程序員，悟道者，熱愛分享，喜歡積極向上樂觀高效的生活。愿與更多志同道合者成為好友，分享交流。
