Burden 分析，是基于基因的關(guān)聯(lián)分析方法中的一種，應(yīng)該與基于位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)分析（GWAS），起到相輔相成，互相補(bǔ)充的作用。 傳統(tǒng)GWAS分析，主要是利用大樣本量，尋找病例對(duì)照...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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基于基因的關(guān)聯(lián)分析的簡(jiǎn)單背景說明
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基因相關(guān)性的計(jì)算在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組解析肥厚性心肌病發(fā)病機(jī)制[http://www.itdecent.cn/p/f270b9431427]里面看到計(jì)算某基因與其它基因的相關(guān)性 方法里寫的是這樣做...
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單細(xì)胞之富集分析-5：一張圖展示多組富集分析結(jié)果單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 單細(xì)胞之富集分析-2：批量...
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MAGMA軟件實(shí)現(xiàn)gene-based & gene-set-based關(guān)聯(lián)分析
作者：Bio_gevin審稿：童蒙編輯：amethyst 隨著全基因組關(guān)聯(lián)分析使用樣本數(shù)量的增加，人們也逐漸認(rèn)識(shí)到很多感興趣的性狀在本質(zhì)上是由微效多基因控制。單個(gè)SNP的關(guān)聯(lián)...
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GO/KEGG富集分析及R包繪圖（氣泡圖/條形圖）導(dǎo)讀 利用富集分析，我們可以把很多看著雜亂的差異基因總結(jié)出一個(gè)比較整體反應(yīng)事件發(fā)生的概述性的句子。 例如：TP53信號(hào)通路和胃癌的發(fā)生有關(guān)。而不是說BAX、BID、ABL1、...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘?qū)崙?zhàn)：文獻(xiàn)復(fù)現(xiàn)（一）批量讀取數(shù)據(jù)最近開始接觸單細(xì)胞數(shù)據(jù)，網(wǎng)上也有很多學(xué)習(xí)資料，琳瑯滿目，我也挑了一些視頻資料進(jìn)行學(xué)習(xí)，不過感覺還是需要進(jìn)行實(shí)戰(zhàn)訓(xùn)練才能更好地掌握這些知識(shí)，所以選了一篇2021年發(fā)表在natu...
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
拖拖拉拉用了一年時(shí)間才把GWAS整個(gè)流程捋完，從背景到code、還有過程中遇到的一些bug以及解決辦法，加起來也有二十余篇，按分析的流程整理出一份清單，也許以后有新的方法或者...
