劉小澤寫于18.11.21聚類樹是個(gè)有意思的東西，可以十分直觀地看到每個(gè)物種的親緣關(guān)系之前沒(méi)有涉及到相關(guān)的分析，相關(guān)的工具只是聽說(shuō)過(guò)大家都在用的MEGA，另外還有Y叔的ggt...
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一起來(lái)爬聚類樹！ -
samtools 安裝
引用：http://www.itdecent.cn/p/6b7a442d293f[http://www.itdecent.cn/p/6b7a442d293f]https:...
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ascp 安裝和下載
安裝 下載 ascp 報(bào)錯(cuò) ascp:private key file not found at path 找個(gè)asperaweb_id_dsa.openssh 文件復(fù)制過(guò)去...
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我只是知識(shí)的搬運(yùn)工~
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@走近生命 謝謝
火山圖總結(jié)
嗯嗯，事情是這樣的，最近要畫一個(gè)火山圖。于是呢，看了一下小潔老師的教程以及很多的教程，終于想起來(lái)要整理一下筆記。嗯，先開著這個(gè)貼。提醒自己。
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使用rsync下載PDB數(shù)據(jù)庫(kù)
2018.5.28 星期一 多云 biolearn 從PDB數(shù)據(jù)庫(kù)下載復(fù)合物的結(jié)構(gòu)有兩種方式，一是直接通過(guò)網(wǎng)頁(yè)檢索下載，二是使用rsync從PDB ftp端下載。 下載指...
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上百個(gè)動(dòng)植物基因組組裝（華中農(nóng)已畢業(yè)的生物狗）的分析小經(jīng)驗(yàn)~不定時(shí)記錄日常搬磚踩坑記錄~<br>學(xué)無(wú)止境，溫故而知新~說(shuō)清楚問(wèn)題，有問(wèn)有回，禮貌的人才能得到回復(fù)
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利用NetworkAnalyst在線工具對(duì)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中表達(dá)基因進(jìn)行差異分析上一個(gè)課程，我們對(duì)NetworkAnalyst在線工具進(jìn)行概述，簡(jiǎn)單回顧一下，我們使用的NetworkAnalyst包括五個(gè)功能模塊，分別是 1）Gene list inpu...
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簡(jiǎn)單小需求：如何將FPKM轉(zhuǎn)換成TPM？
劉小澤寫于19.2.21或許這還是個(gè)比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析，得到的結(jié)果可能是FPKM。但是FPKM確實(shí)存在不準(zhǔn)確性，推薦使用TPM。 read count和FPKM...
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Motif和domain的區(qū)別Protein domain： 結(jié)構(gòu)域domain的概念由Wetlaufer于1973年首次提出，他定義結(jié)構(gòu)域?yàn)榭梢宰詣?dòng)折疊的穩(wěn)定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)單位。過(guò)去，結(jié)構(gòu)域被描述為，折疊...
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蛋白和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析數(shù)據(jù)庫(kù)推薦現(xiàn)在多組學(xué)研究很火，今天小編給大家介紹幾個(gè)蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析實(shí)用數(shù)據(jù)庫(kù)： 1 CRN（Cancer RNA-Seq Nexus）數(shù)據(jù)庫(kù) 網(wǎng)址：http://sysl...
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R語(yǔ)言轉(zhuǎn)錄組分析-GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載及Illumina數(shù)據(jù)處理一、簡(jiǎn)單認(rèn)識(shí)一下GEO數(shù)據(jù)庫(kù) 入口：在NCBI主頁(yè) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 的搜索入口輸入關(guān)鍵字，比如某個(gè)基因或某個(gè)疾病，選擇數(shù)據(jù)類型為GE...
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