在GWAS研究中,Manhattan plot和QQ plot是最常畫的兩類圖,它們可以把跟研究的性狀(比如,基因型和身高)顯著相關的基因位點清晰地展現(xiàn)出來,不少讀者朋友應該...
先把GWAS系列課程看一遍,后面再把不懂的東西再補充上來 一、概念和理論基礎 全基因組關聯(lián)分析定義 是對多個個體在全基因組范圍的遺傳變異(標記)多態(tài)性進行檢測,獲得基因型,進...
在拿到一組snp數(shù)據(jù)時,首先應該想到要對snp數(shù)據(jù)的質量進行檢測和控制。然后再考慮這組數(shù)據(jù)該怎么分析,如何分析。snp的質控是非常重要的,如果snp數(shù)據(jù)的質量不佳,那么計算的...
y一、認識文件名 五大格式文件:ped&mapbed&fam&bim 各自存儲何種數(shù)據(jù) 五種格式 ①ped(pedigree,家系):包含樣本的譜系信息和基因型信息,必須與f...
轉載自-----http://www.itdecent.cn/p/963343b5e135 核酸數(shù)據(jù)庫 NCBI [https://www.ncbi.nlm.nih.gov...
Pfam 數(shù)據(jù)庫 http://pfam.xfam.org/是一個蛋白質結構域家族的集合。蛋白質一般由一個或多個功能區(qū)域組成,這些功能區(qū)域通常被稱為結構域(domain)。在...
一. 簡介 在基因組數(shù)據(jù)分析過程中,我們可以將fastq,fasta,ONT等不同格式的數(shù)據(jù)mapping到參考基因組上,然后通過IGV進行可視化,結合GFF3文件手工對感興...
不廢話直接上干貨:https://long-read-tools.org/到目前2020年2月13日為止這個網(wǎng)站收集整理了354種用于分析長度長數(shù)據(jù)的工具,可以根據(jù)自己的需求...
大家好!我是Honglei,歡迎大家來到基因組學專欄! 今天我們將對基因組學進行介紹。 什么是基因組學? 基因組學(Geonomics)是一門研究基因組(Genome)的科學...