第四周 2018— 06.11-06.17原文: chromVAR: Inferring transcription factor-associated accessibil...
學(xué)習(xí)目標(biāo): 學(xué)會(huì)用MACS2 call peaks 理解MACS2 call peaks的結(jié)果 Peak Calling Peak calling即利用計(jì)算的方法找出ChIP...
在多篇高分文章中都出現(xiàn)了評估細(xì)胞亞群純度的內(nèi)容,用到的是張澤民團(tuán)隊(duì)的ROGEU包。提出了一個(gè)基于熵的統(tǒng)計(jì)量(ROGUE)來準(zhǔn)確地定量鑒定的細(xì)胞團(tuán)的純度,可應(yīng)用于所有測試的sc...
系列回顧:ArchR官網(wǎng)教程學(xué)習(xí)筆記1:Getting Started with ArchR[http://www.itdecent.cn/p/a2bcdfb77961]A...
背景:單細(xì)胞ATAC分析流程介紹。 1.為什么做單細(xì)胞ATAC分析? 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析的是單細(xì)胞分辨率上不同細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)錄組(mRNA)差異,由中心法則可以知道,生物發(fā)生的過...
作者:Jenny審稿:童蒙編輯:angelica 近幾年來,單細(xì)胞測序技術(shù)一直是討論熱度極其高的話題,除了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,單細(xì)胞ATAC也逐漸引起科研人員的興趣。那么,它與我們...