大家好,好久不見(jiàn),這個(gè)公眾號(hào)目前只有我在寫(xiě),所有更新隨心所欲,想起來(lái)什么就發(fā)點(diǎn)啥,也不為掙錢,希望能跟大家分享一些自己在生信學(xué)習(xí)中的感受。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來(lái)...
書(shū)接上回,之前我們?cè)凇秏eta分析的基本步驟是什么?附實(shí)例講解,7步快速見(jiàn)刊策略》文章里詳細(xì)給大家介紹了撰寫(xiě)一篇Meta分析需要經(jīng)過(guò)哪些步驟。 今天我們就從這些步驟入手,給大...
前面已經(jīng)簡(jiǎn)單介紹過(guò)GWAS的概念,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程,我們?cè)贕WAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會(huì)看到beta值和P值,他們分別代表什么意思?這兩個(gè)值又有什么關(guān)系呢...
集成多組學(xué)數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用大綱 機(jī)器學(xué)習(xí)及生物組學(xué)基礎(chǔ)(提前贈(zèng)送視頻) 學(xué)習(xí)目標(biāo):對(duì)機(jī)器學(xué)習(xí)基本概念進(jìn)行介紹,讓大家對(duì)機(jī)器學(xué)習(xí)基本概念有大致了解。明確機(jī)器學(xué)習(xí)...
在做機(jī)器學(xué)習(xí)項(xiàng)目的時(shí)候,一開(kāi)始我們會(huì)將數(shù)據(jù)集分為訓(xùn)練集和測(cè)試集,要記住測(cè)試集只能用一次,只能用來(lái)評(píng)估最終最好的模型。如果你反復(fù)去使用測(cè)試集,反復(fù)測(cè)試后從里面挑最好的,你就是在...
一:簡(jiǎn)單散點(diǎn)圖(以銷售收入和年輕人人數(shù)為例)(1)步驟:圖形->舊對(duì)話框->散點(diǎn)圖->簡(jiǎn)單散點(diǎn)圖->定義->加入變量->點(diǎn)擊確定(2)會(huì)出現(xiàn)如圖所示界面(按圖中所示加入變量)...
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因 原創(chuàng) 生信技能樹(shù) 我在生信技能樹(shù)多次寫(xiě)教程分享WGCNA的實(shí)戰(zhàn)細(xì)節(jié),見(jiàn): 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版)[ht...
線性回歸模型是研究連續(xù)型變量與一組自變量之間的關(guān)系。也就是說(shuō)線性回歸模型的因變量是連續(xù)型變量。如果因變量是分類變量,則是非線性的,此時(shí)需要用Logistic回歸,對(duì)其發(fā)生概率...
參考代碼在這: 1 差異分析 需要的數(shù)據(jù):表達(dá)矩陣、分組矩陣、差異比較矩陣 至此獲得了差異分析矩陣nrDEG 2 繪圖 2.1 熱圖 可以查看到高表達(dá)和低表達(dá)的基因。 2.2...
0.數(shù)據(jù)介紹 這是一篇發(fā)表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Medulloblastoma R...
作為一個(gè)既沒(méi)有任何經(jīng)費(fèi)也沒(méi)有基礎(chǔ)科研條件的醫(yī)學(xué)小白,需要申請(qǐng)課題,該怎么辦呢?俗話說(shuō)得好:”辦法總比困難多”。沒(méi)有經(jīng)費(fèi)、沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的情況下,也能想到并設(shè)計(jì)好一個(gè)課題,進(jìn)行申請(qǐng)基...
簡(jiǎn)介批量處理函數(shù)有很重要的apply族函數(shù):lapply sapply apply tapply mapply。這些函數(shù)底層通過(guò)C實(shí)現(xiàn),效率比手工遍歷高效。apply族函數(shù)是...
摘要: 背景:NASH是導(dǎo)致肝移植的重要隱私,現(xiàn)行的多項(xiàng)研究只在評(píng)估NASH的潛在治療方法。法尼醇X受體(farnesoid X receptor, FXR)配體奧尼膽酸(o...