發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣西壯族自治區(qū)
-
孟德?tīng)栯S機(jī)化GWAS完整的VCF文件列名都是什么意思大家好，好久不見(jiàn)，這個(gè)公眾號(hào)目前只有我在寫(xiě)，所有更新隨心所欲，想起來(lái)什么就發(fā)點(diǎn)啥，也不為掙錢，希望能跟大家分享一些自己在生信學(xué)習(xí)中的感受。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來(lái)...
-
Meta分析軟件盤點(diǎn)，做Meta要用哪些軟件？含meta分析軟件安裝包！書(shū)接上回，之前我們?cè)凇秏eta分析的基本步驟是什么？附實(shí)例講解，7步快速見(jiàn)刊策略》文章里詳細(xì)給大家介紹了撰寫(xiě)一篇Meta分析需要經(jīng)過(guò)哪些步驟。 今天我們就從這些步驟入手，給大...
-
GWAS分析-P值和beta值的愛(ài)恨相殺 (六)前面已經(jīng)簡(jiǎn)單介紹過(guò)GWAS的概念，GWAS分析中所用到的文件以及分析流程，我們?cè)贕WAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會(huì)看到beta值和P值，他們分別代表什么意思？這兩個(gè)值又有什么關(guān)系呢...
-
集成多組學(xué)數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用集成多組學(xué)數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用大綱 機(jī)器學(xué)習(xí)及生物組學(xué)基礎(chǔ)（提前贈(zèng)送視頻） 學(xué)習(xí)目標(biāo)：對(duì)機(jī)器學(xué)習(xí)基本概念進(jìn)行介紹，讓大家對(duì)機(jī)器學(xué)習(xí)基本概念有大致了解。明確機(jī)器學(xué)習(xí)...
-
R機(jī)器學(xué)習(xí)：重復(fù)抽樣在機(jī)器學(xué)習(xí)模型建立過(guò)程中的地位理解
在做機(jī)器學(xué)習(xí)項(xiàng)目的時(shí)候，一開(kāi)始我們會(huì)將數(shù)據(jù)集分為訓(xùn)練集和測(cè)試集，要記住測(cè)試集只能用一次，只能用來(lái)評(píng)估最終最好的模型。如果你反復(fù)去使用測(cè)試集，反復(fù)測(cè)試后從里面挑最好的，你就是在...
-
NHANES連載教程，輕松解鎖新技能
-
散點(diǎn)圖的繪制（spss)一：簡(jiǎn)單散點(diǎn)圖（以銷售收入和年輕人人數(shù)為例）（1）步驟：圖形->舊對(duì)話框->散點(diǎn)圖->簡(jiǎn)單散點(diǎn)圖->定義->加入變量->點(diǎn)擊確定（2）會(huì)出現(xiàn)如圖所示界面（按圖中所示加入變量）...
-
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因
WGCNA得到模塊之后如何篩選模塊里面的hub基因 原創(chuàng) 生信技能樹(shù) 我在生信技能樹(shù)多次寫(xiě)教程分享WGCNA的實(shí)戰(zhàn)細(xì)節(jié)，見(jiàn)： 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版)[ht...
-
R語(yǔ)言 Logistic回歸~模型構(gòu)建
線性回歸模型是研究連續(xù)型變量與一組自變量之間的關(guān)系。也就是說(shuō)線性回歸模型的因變量是連續(xù)型變量。如果因變量是分類變量，則是非線性的，此時(shí)需要用Logistic回歸，對(duì)其發(fā)生概率...
-
【GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘】四、差異分析（limma）、繪圖和富集分析參考代碼在這： 1 差異分析 需要的數(shù)據(jù)：表達(dá)矩陣、分組矩陣、差異比較矩陣 至此獲得了差異分析矩陣nrDEG 2 繪圖 2.1 熱圖 可以查看到高表達(dá)和低表達(dá)的基因。 2.2...
-
GSE120974多組學(xué)分析復(fù)現(xiàn)0.數(shù)據(jù)介紹 這是一篇發(fā)表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Medulloblastoma R...
-
醫(yī)學(xué)小白也可以利用生信快速設(shè)計(jì)出一個(gè)課題
作為一個(gè)既沒(méi)有任何經(jīng)費(fèi)也沒(méi)有基礎(chǔ)科研條件的醫(yī)學(xué)小白，需要申請(qǐng)課題，該怎么辦呢？俗話說(shuō)得好：”辦法總比困難多”。沒(méi)有經(jīng)費(fèi)、沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的情況下，也能想到并設(shè)計(jì)好一個(gè)課題，進(jìn)行申請(qǐng)基...
-
apply、lapply、sapply、mapply、tapply函數(shù)
簡(jiǎn)介批量處理函數(shù)有很重要的apply族函數(shù)：lapply sapply apply tapply mapply。這些函數(shù)底層通過(guò)C實(shí)現(xiàn)，效率比手工遍歷高效。apply族函數(shù)是...
-
堅(jiān)持文獻(xiàn)閱讀D1（2022-08-20）摘要： 背景：NASH是導(dǎo)致肝移植的重要隱私，現(xiàn)行的多項(xiàng)研究只在評(píng)估NASH的潛在治療方法。法尼醇X受體（farnesoid X receptor, FXR）配體奧尼膽酸（o...
