1.課程回顧 例1:房價和面積—預測 給定一組房價和房屋面積的數(shù)據(jù)集,通過機器學習算法(監(jiān)督學習)來擬合畫出一條線,根據(jù)這條線來對未知的數(shù)據(jù)進行判斷。 假設機器通過這些房價數(shù)...
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論文 Microbiomes in the Challenger Deep slope and bottom-axis sediments https://www.natur...
導讀 HUMAnN(全稱HMP Unified Metabolic Analysis Network)最早由Curtis Huttenhower團隊針對HMP項目開發(fā)的一款可...
MGCA Microbial genome component and annotation pipeline Introduction The software under...
CAZy數(shù)據(jù)庫簡介 CAZy 全稱為Carbohydrate-Active enZYmes Database,碳水化合物酶相關的專業(yè)數(shù)據(jù)庫,內(nèi)容包括能催化碳水化合物降解、修飾...
PGCGAP 是用于原核生物基因組學和比較基因組學分析管道,目前該管道包含 12 個模塊,可以接受 Illumina 雙端 reads、Oxford reads 或 PacB...
使用場景 假設有一個 fasta 格式的序列文件SRR9620252.faa,我們想要提取其中的一些序列到一個新的文件中,我們擁有這些序列的 id (假設這些 id 存放在文...
docker本地默認是unix socket,這里報錯是使用了tcp,默認情況下,Unix的socket屬于用戶root,其它用戶要使用要通過sudo命令。由于這個原因,do...
@朱橘橘 現(xiàn)在一般都不用虛擬機了,Bio-linux應該也是多年未更新了吧。如果是WIN10系統(tǒng),可以直接安裝WSL,自己裝軟件??蓞⒖嘉业牧硪黄恼?,有視頻教程(https://protocolexchange.researchsquare.com/article/pex-807/v5)
生物信息學1:虛擬機 & Bio-linux安裝與配置前言:大家按照步驟從頭看到尾,末尾有常見錯誤解決辦法,如果有其他問題,大家先看錯誤提示,根據(jù)提示自行百度,很多問題都可以得到解決,實在解決不了的可以問我,謝謝!找我遠程的,先...
主程序就是壓縮包里的“kSNP3”文件,可以用任何文本編輯器打開,還有問題可加群“生信之巔”
kSNP3尋找SNPs并構建進化樹1. kSNP3 安裝 cd ~/toolswgethttps://sourceforge.net/projects/ksnp/files/kSNP3.1_Linux_pac...
問題與適用性描述 繪圖的時候一般是默認圖背景大小或指定大小,但是多數(shù)圖片需要展示的內(nèi)容不是固定的,兩種方法都會導致圖片過大或過小,解決方法是根據(jù)圖片內(nèi)容自動設置背景大小,這里...
本節(jié)來介紹如何通過ggplot2繪制復雜熱圖 加載R包 加載數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)清洗 繪制熱圖 ggtree繪制聚類樹 繪制樣本分類色條 基因長度信息可視化 基因平均表達量可視化 展示...