@莎莉噢 不好意思剛看到,是的呀,但你需要load raw matrix,不是filtered。
用soupX對(duì)環(huán)境基因表達(dá)做估量和矯正基于液滴的單細(xì)胞捕獲方法通常其單細(xì)胞液滴也會(huì)捕獲環(huán)境基因(ambient RNA)。環(huán)境基因的表達(dá)由于并不來(lái)自barcode細(xì)胞,會(huì)導(dǎo)致基因表達(dá)矩陣計(jì)數(shù)不準(zhǔn)確,更會(huì)影響用標(biāo)記...