早些時(shí)候由于工作條件和需要，在電腦上安裝了雙系統(tǒng)。目前工作條件改善了，有了開(kāi)發(fā)工控機(jī)，就不要PC上的Ubuntu系統(tǒng)了。 首先查看系統(tǒng)信息： 我的PC為UEFI的方式，直接采...
IP屬地：湖北
-
win+ubuntu雙系統(tǒng)刪除Ubuntu
-
GWAS表型數(shù)據(jù)處理參考：多年多點(diǎn)數(shù)據(jù)如何計(jì)算遺傳力以及BLUP值[https://blog.csdn.net/yijiaobani/article/details/90215314]如何計(jì)算多...
-
從表達(dá)量矩陣求各處理組的平均值（勘誤版）
上一篇文章我提到了從表達(dá)量矩陣畫(huà)時(shí)序性（或者多處理）的單基因的折線圖，實(shí)際上我們的表達(dá)量矩陣?yán)锩婷總€(gè)處理是有2-3個(gè)重復(fù)的。所以用來(lái)畫(huà)折線圖的矩陣應(yīng)該是合并了重復(fù)，求得平均值...
-
每周文獻(xiàn) 2022-05-02大家好，本周給大家分享的是最近發(fā)表在NG上與油菜育種中農(nóng)藝性狀的基因組選擇和遺傳結(jié)構(gòu)相關(guān)的一篇文章。 文章題目：Genomic selection and genetic a...
-
基因組survey分析
基因組survey分析內(nèi)容 基因組Survey基于小片段文庫(kù)的低深度測(cè)序數(shù)據(jù)(50X-100X ) ; 通過(guò)K-mer分析 ,有效的評(píng)估基因組大小、GC含量、雜合度以及重復(fù)序...
-
生信 | 基因組組裝實(shí)戰(zhàn)（一）：基礎(chǔ)知識(shí)與基本思路寫(xiě)在前面 以下內(nèi)容均來(lái)自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班課堂筆記 1. Genome de nove 基礎(chǔ)知...
-
FastqCount的安裝與使用
FastqCount (https://github.com/zhimenggan/FastqCount)[https://github.com/zhimenggan/Fas...
-
基因家族分析7 || 順式作用元件分析第六部分暫時(shí)發(fā)現(xiàn)一點(diǎn)問(wèn)題，改天補(bǔ)充~ 基因家族流程：基因家族分析（一）[http://www.itdecent.cn/p/34333a6d7c4e] 基因家族流程：基因家族...
-
Bioinformatics Workbook：一個(gè)生信學(xué)習(xí)網(wǎng)站 | 不需要翻 | 示例數(shù)據(jù)+代碼> 推薦一個(gè)生信學(xué)習(xí)網(wǎng)站：`Bioinformatics Workbook` > 網(wǎng)站地址：https://bioinformaticsworkbook.org/[https...
-
-
ggplot2繪制帶有標(biāo)準(zhǔn)差圖ggplot2-為折線圖和條形圖添加誤差線 以ToothGrowth數(shù)據(jù)為例,進(jìn)行處理 tg <- ToothGrowth head(tg) library(ggplot2)...
-
[R] 添加誤差棒的分組折線圖：geom_path: Each group consists of only one observation. Do you need to adjust the...想做一個(gè)簡(jiǎn)單的分組折線圖，并添加誤差棒，類似下面這樣的： 計(jì)算誤差需要安裝Rmisc包中的summarySE函數(shù)。 數(shù)據(jù)變成這樣： 接下來(lái)就是作圖了。 得到警告： 我想了想，...
-
利用ggplot2繪制折線圖（均值+誤差棒）由于實(shí)驗(yàn)需要，幫師姐畫(huà)了一張折線圖。特此感謝師姐提供數(shù)據(jù)給我鍛煉的機(jī)會(huì)！ 成品圖如下 直接上代碼 1. 讀入數(shù)據(jù) 2. 計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)差 3. 繪制折線圖 結(jié)果如圖所示，從圖中可以...
-
WGS全流程的學(xué)習(xí)筆記
Part1 數(shù)據(jù)下載 先去Korean Personal Genome Project下載了編號(hào)為KPGP-00001的數(shù)據(jù)。 先說(shuō)一下KPGP吧，中文名叫韓國(guó)個(gè)人基因組計(jì)...
-
14.GO富集分析R語(yǔ)言代碼及5種圖的繪制一、舉例回顧 本節(jié)使用GSE1009數(shù)據(jù)集，已經(jīng)用limma包對(duì)數(shù)據(jù)集中的樣本進(jìn)行差異分析，現(xiàn)對(duì)差異基因(DEGs)做GO富集分析。 GSE1009數(shù)據(jù)集介紹： 樣本量：共6...
-
GWAS 總體流程理解版
自己找了一些文章和視頻，先總結(jié)了一部分，后面再做補(bǔ)充和實(shí)操 一. 相關(guān)概念理解 （1）GWAS： 全稱“全基因組關(guān)聯(lián)分析”，使用統(tǒng)計(jì)模型找到與性狀關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)，用于分子標(biāo)記選擇...
-
重測(cè)序-棉花GWAS助力Nature Genetics
GWAS+轉(zhuǎn)錄組：從單一組學(xué)到組學(xué)，為作物育種開(kāi)啟更多的切入點(diǎn)，挖掘作物研究作物研究新亮點(diǎn)。利用多種技術(shù)，相輔相成，精確定位基因，層層敲定新基因。 研究背景：對(duì)棉花基因組變異...
-
