關(guān)于OrthoFinder 的介紹、安裝、使用等資料匯總。
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
-
-
-
2021-11-23集群安裝R包GOstats安裝R包GOstats，出現(xiàn)以下錯(cuò)誤： ERROR: dependency ‘httr’ is not available for package ‘KEGGREST’ * ...
-
2021-08-04：GO富集網(wǎng)絡(luò)可視化工具利用Cytoscape上的插件可以實(shí)現(xiàn)GO 分析的網(wǎng)絡(luò)化，不過非模式植物會(huì)很麻煩：具體參考了簡(jiǎn)書的以下內(nèi)容： Bingo(Cytoscape插件)GO功能富集分析 - 簡(jiǎn)書 ...
-
主要關(guān)注于脊椎動(dòng)物適應(yīng)性進(jìn)化與比較基因組學(xué)研究<br>簡(jiǎn)書原賬號(hào)：WhyDoWeAge
-
GO富集可視化：clusterProfiler+GOplot現(xiàn)在的社會(huì)正處于大數(shù)據(jù)時(shí)代，生物學(xué)研究領(lǐng)域也迎來了大組學(xué)時(shí)代。無論是植物。動(dòng)物，還是微生物，都有許多物種被測(cè)序。在后續(xù)的個(gè)性化分析過程中，通常會(huì)得到龐大的基因數(shù)據(jù)，如何選擇一...
-
喜歡深海鯨魚的悲鳴，也熱愛歡快的鳥語花香！<br>
-
-
2021-07-09：細(xì)數(shù)我在GO注釋時(shí)遇到的那些報(bào)錯(cuò)
上回說到，我廢了九牛二虎之力，終于拿到了百十來個(gè)GB的GO EVIDENCE 數(shù)據(jù)，你猜怎么著，接著往下進(jìn)行的時(shí)候發(fā)現(xiàn)，R語言根本讀不了。。。。心疼自己一秒鐘 來吧，今天接著...
-
2021-07-04--GO富集之馬鈴薯的EVIDENCE不好搞
一連試了幾天用集群的R構(gòu)建EVIDENCE,結(jié)果并不能讓我滿意，基本上一天只能跑一個(gè)，再運(yùn)行第二個(gè)的時(shí)候就會(huì)報(bào)錯(cuò)。嘗試到現(xiàn)在就只剩下馬鈴薯的還未成功了，暫時(shí)先把問題撂在這，我...
-
2021-07-01
昨天忙著做實(shí)驗(yàn)，沒時(shí)間鼓搗數(shù)據(jù)，今天也得做實(shí)驗(yàn)，不過在試驗(yàn)開始之前還是先整理一下吧： 首先是安裝R包 嘗試本地運(yùn)行后發(fā)現(xiàn)，報(bào)錯(cuò)： 本地內(nèi)存太小，程序無法運(yùn)行。 到集群上運(yùn)行，...
-
2021-06-29：Go注釋的相關(guān)操作記錄主要參考：(4條消息) 無參轉(zhuǎn)錄組GO、KEGG富集分析——diamond+idmapping+GOstats_ygyxl的博客-CSDN博客[https://blog.cs...
-
Linux集群中安裝miniconda2主要參考：conda管理生信軟件一文就夠 (qq.com)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=224...
-
2021-06-28 Rstdio中DESeq2相關(guān)軟件的安裝
#首先升級(jí)R install.packages("installr") library(installr) updateR() library("BiocManager") ...
-
2021-06-27--致病疫霉的差異基因表達(dá)分析
在Rstdio軟件里使用DESeq2進(jìn)行致病疫霉及茄科植物的差異基因表達(dá)分析，茄科植物由于隸屬不同物種，各個(gè)基因有所差異，故優(yōu)先進(jìn)行縱向比較，即比較接種不同時(shí)間點(diǎn)下同一植物的...
-
生物信息學(xué)<br>干細(xì)胞轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)
-
簡(jiǎn)書太垃圾了，已經(jīng)棄用，改用語雀
-
-
