分享一些簡單的指令，以及conda的安裝。 whoami 可以查看當(dāng)前使用賬號 / 表示根目錄 以根目錄為開始位置編寫的路徑叫做絕對路徑 ...
發(fā)簡信
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繪制差異基因kegg注釋圖
“差異基因kegg注釋圖”是轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的重要組成部分，能夠幫助大家了解差異基因分屬于哪些代謝通路，文章中如果能夠插入下面這類圖來說明樣品間的差異，一定會為你的文章增色不少...
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生信小白——初學(xué) samtools上文提到用bowtie2獲得了三個sam文件，但通常會將其轉(zhuǎn)化為bam文件進(jìn)行查閱。 使用conda下載samtools工具，過程參考《生信小白——初學(xué)bowtie2》。 s...
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生信小白——初學(xué) bowtie2
本文就以生信小白的角度，簡述bowtie2的下載、安裝及使用。關(guān)于bowtie2的使用教程非常豐富，具體的概念本文不再贅述，只對操作過程進(jìn)行簡(xi)簡(zhi)單(ru)單...
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@hsy_hzauer 非常感謝你的回復(fù)！我現(xiàn)在掌握一些簡單地指令。因?yàn)槲以诮鉀Q實(shí)際問題上還有些困難，稍后我會把我的問題具體寫在文章里，麻煩你能解答一下嗎？
mRNA-seq學(xué)習(xí)（二）：Bowtie2比對
1. 比對之前需要考慮哪些問題 1. 選什么作為參考序列 基因組序列既能做表達(dá)定量，還能發(fā)現(xiàn)新的基因和轉(zhuǎn)錄本 轉(zhuǎn)錄本序列（CDS / cDNA / 基因集）表達(dá)定量 2 gf...
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你好，我是一名生信初學(xué)者，有幾個問題想請教~我是Mac連接服務(wù)器終端環(huán)境下操作的，建索引是在我bowtie2程序目錄下進(jìn)行還是在我的根目錄下進(jìn)行？參考基因組我已經(jīng)上傳至服務(wù)器，需要放在程序目錄下嘛？如果放在其他目錄下應(yīng)該怎么輸入？還望不吝賜教~謝謝
mRNA-seq學(xué)習(xí)（二）：Bowtie2比對
1. 比對之前需要考慮哪些問題 1. 選什么作為參考序列 基因組序列既能做表達(dá)定量，還能發(fā)現(xiàn)新的基因和轉(zhuǎn)錄本 轉(zhuǎn)錄本序列（CDS / cDNA / 基因集）表達(dá)定量 2 gf...
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