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  • Phenotype : 大規(guī)模表型數(shù)據(jù)處理工具

    表型數(shù)據(jù)的處理,一直是困擾許多同學(xué)的問題。面對大規(guī)模的表型數(shù)據(jù),如果不會編程,純用Excel的話,往往會消耗大量精力。為了解決大規(guī)模表型數(shù)據(jù)難以...

  • 比對得到的SAM文件怎么看?

    歡迎關(guān)注微信公眾號“生信小王子”! SAM ( Sequence Alignment Map ) 文件是reads比對到基因組后得到的結(jié)果文件,...

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    轉(zhuǎn)錄組分析 | 使用STAR進行比對

    歡迎關(guān)注微信公眾號“生信小王子”! 前幾期,小編已經(jīng)教大家完成了RNA-seq數(shù)據(jù)的質(zhì)控,下面就要正式開始轉(zhuǎn)錄組分析啦! 通過二代測序我們可以獲...

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    R語言繪圖 | 使用pheatmap快速繪制熱圖

    歡迎關(guān)注微信公眾號“生信小王子”!熱圖是我們展示數(shù)據(jù)時常用的圖形,今天小編教大家使用"pheatmap"快速繪制熱圖。 首先,我們需要準(zhǔn)備輸入文...

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  • R語言繪圖 | 給箱線圖加個點

    歡迎關(guān)注微信公眾號“生信小王子”!箱線圖是我們展示數(shù)據(jù)時常用的一種統(tǒng)計圖形。但是箱線圖有時候并不能很好的展示數(shù)據(jù)的離差,目前已經(jīng)不被許多高水平的...

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    轉(zhuǎn)錄組分析 | 使用FastQC進行數(shù)據(jù)質(zhì)控

    隨著測序成本的不斷降低,RNA-seq已經(jīng)是許多實驗的標(biāo)配。經(jīng)過小編一段時間的準(zhǔn)備,接下來的幾周時間里,將推出一系列的轉(zhuǎn)錄組分析教程,教大家從零...

  • Linux基礎(chǔ)入門 | 文件操作命令

    最近很多師弟師妹和我講,老師安排他們做生物信息學(xué)分析,但是不知道從何入手學(xué)習(xí),每每翻開一本本厚厚的教程,總是提不起興趣。我一直覺得,基礎(chǔ)生物信息...

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    使用iTOL美化進化樹

    小編之前寫過一篇使用“ggtree" 快速美化進化樹的文章(使用ggtree對進化樹進行分組美化 - 簡書),但是有好多同學(xué)反映不會使用R語言,...

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  • 使用ggtree對進化樹進行分組美化

    最近,小編的老師想要在一張進化樹上標(biāo)出不同來源的材料,平時這種“累活”小編都是使用iTOL、evolview等工具進行手動美化的,但是這次進化樹...

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