@wow咪來哆 fasta或者fastq格式的數(shù)據(jù)都可以
hifiasm軟件安裝與使用HiFi測序以及hifiasm軟件的使用，目前是市場上二倍體動(dòng)植物基因組組裝的最佳選擇，沒有之一，多倍體目前也是最佳選擇,也正因?yàn)镠iFi跟hifiasm軟件，使得動(dòng)植物基因...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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一致性基因組提取軟件-ANGSD安裝與使用
ANGSD軟件可以基于比對好的bam文件，提取得到與比對用的參考基因組一致性的基因組，有了一致性基因組，可以根據(jù)對應(yīng)參考基因組的gff3文件提取對應(yīng)的原件進(jìn)行比較分析，基于二...
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phyluce軟件安裝與使用
超保守原件UCEs,(ultraconserved elements )，是在進(jìn)化過程中，各個(gè)物種保留的一種保守序列，因此可以通過提取該類序列，從而分析各個(gè)物種的進(jìn)化情況，相...
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動(dòng)物線粒體基因組注釋軟件MITOS2安裝與使用
MITOS2可用于注釋后生動(dòng)物以及真菌等線粒體基因組注釋，主要注釋線粒體18個(gè)核心基因（atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2 cox3 dpo lagli...
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PlantCARE預(yù)測植物啟動(dòng)子-順式作用元件啟動(dòng)子 啟動(dòng)子是RNA 聚合酶識(shí)別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列，多數(shù)位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游,啟動(dòng)子本身不被...
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linux
WGDI軟件（一）：安裝與配置
前言 WGDI軟件對于比較基因組分析非常實(shí)用，能夠分析全基因組復(fù)制事件，識(shí)別同源區(qū)塊，畫共線性點(diǎn)陣圖，求ka、ks值等，小編接下來先帶你安裝該軟件 安裝環(huán)境及配置軟件 （1）...
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@汪大山 是的，兩個(gè)個(gè)體間的IBD
IBD分析軟件germline安裝與使用
Identity by Descent (IBD) ：同源相同片段，是在兩個(gè)及以上個(gè)體存在來源于同一祖先的、未發(fā)生重組的、完全相同的DNA片段，這樣的片段即為IBD片段，詳情...
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基因組及gff3注釋下載總結(jié)對于生信分析，經(jīng)常需要從各種網(wǎng)址下載基因組，小編在此分享一些下載經(jīng)驗(yàn)， （1）參考文獻(xiàn)：對于一個(gè)科學(xué)研究者，可以直接找到研究物種已發(fā)表的基因組文獻(xiàn)，一般情況下，文章會(huì)提供基因...
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hifiasm軟件安裝與使用
HiFi測序以及hifiasm軟件的使用，目前是市場上二倍體動(dòng)植物基因組組裝的最佳選擇，沒有之一，多倍體目前也是最佳選擇,也正因?yàn)镠iFi跟hifiasm軟件，使得動(dòng)植物基因...
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linux系統(tǒng)-界面配色分享
在linux系統(tǒng)創(chuàng)建新的賬號(hào)后，界面顯示基本上是黑白色的，這時(shí)需要添加顯示的色彩，小編這里分享自己的界面配色： 將下面兩行添加到~/.bashrc 若有侵權(quán)，聯(lián)系刪除
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IBD分析軟件germline安裝與使用
Identity by Descent (IBD) ：同源相同片段，是在兩個(gè)及以上個(gè)體存在來源于同一祖先的、未發(fā)生重組的、完全相同的DNA片段，這樣的片段即為IBD片段，詳情...
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@05466c253c6d 我的就是雙端，對著操作，后邊有一個(gè)樣本對應(yīng)雙端的表格
原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中，編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI，要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗(yàn)的不要慌，小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI （一）NCBI賬號(hào)：上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...
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藍(lán)色至少寫一列，并且至少一列名稱需要不一樣,艷樣本名沒有問題
原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中，編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI，要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗(yàn)的不要慌，小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI （一）NCBI賬號(hào)：上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...
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官網(wǎng)有解釋的
線粒體組裝軟件Mitofinder安裝與使用
下載與安裝如下，官網(wǎng)https://github.com/RemiAllio/MitoFinder[https://github.com/RemiAllio/MitoFind...
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CNCB原始數(shù)據(jù)下載CNCB（China National Center for Bioinformation，國家生物信息中心），對標(biāo)的NCBI，對國內(nèi)研究者來說，數(shù)據(jù)上傳跟下載方便的多，現(xiàn)在...
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NCBI原始SRA數(shù)據(jù)下載
下載NCBI數(shù)據(jù)，使用ascp命令是最快的，但是小編之前嘗試用該命令下載SRA數(shù)據(jù)，查閱了百度上的各種參數(shù)，最后還是沒有成功，可能是有個(gè)“墻”存在的原因，小編后來有一段時(shí)間使...
