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  • @wow咪來哆 fasta或者fastq格式的數(shù)據(jù)都可以

    hifiasm軟件安裝與使用

    HiFi測序以及hifiasm軟件的使用,目前是市場上二倍體動植物基因組組裝的最佳選擇,沒有之一,多倍體目前也是最佳選擇,也正因為HiFi跟hifiasm軟件,使得動植物基因...

  • 一致性基因組提取軟件-ANGSD安裝與使用

    ANGSD軟件可以基于比對好的bam文件,提取得到與比對用的參考基因組一致性的基因組,有了一致性基因組,可以根據(jù)對應(yīng)參考基因組的gff3文件提取對應(yīng)的原件進(jìn)行比較分析,基于二...

  • phyluce軟件安裝與使用

    超保守原件UCEs,(ultraconserved elements ),是在進(jìn)化過程中,各個物種保留的一種保守序列,因此可以通過提取該類序列,從而分析各個物種的進(jìn)化情況,相...

  • 動物線粒體基因組注釋軟件MITOS2安裝與使用

    MITOS2可用于注釋后生動物以及真菌等線粒體基因組注釋,主要注釋線粒體18個核心基因(atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2 cox3 dpo lagli...

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    PlantCARE預(yù)測植物啟動子-順式作用元件

    啟動子 啟動子是RNA 聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列,多數(shù)位于結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄起始點的上游,啟動子本身不被...

  • linux

    WGDI軟件(一):安裝與配置

    前言 WGDI軟件對于比較基因組分析非常實用,能夠分析全基因組復(fù)制事件,識別同源區(qū)塊,畫共線性點陣圖,求ka、ks值等,小編接下來先帶你安裝該軟件 安裝環(huán)境及配置軟件 (1)...

  • 作用不一樣

    一些常用小腳本記錄

    記錄下小編自己可能用到的小腳本 (1)fasta轉(zhuǎn)phylip格式 用法:python fa2phy.py seq.fasta seq.phy (2)fastq轉(zhuǎn)fast...

  • 一些常用小腳本記錄

    記錄下小編自己可能用到的小腳本 (1)fasta轉(zhuǎn)phylip格式 用法:python fa2phy.py seq.fasta seq.phy (2)fastq轉(zhuǎn)fast...

  • @汪大山 是的,兩個個體間的IBD

    IBD分析軟件germline安裝與使用

    Identity by Descent (IBD) :同源相同片段,是在兩個及以上個體存在來源于同一祖先的、未發(fā)生重組的、完全相同的DNA片段,這樣的片段即為IBD片段,詳情...

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    基因組及gff3注釋下載總結(jié)

    對于生信分析,經(jīng)常需要從各種網(wǎng)址下載基因組,小編在此分享一些下載經(jīng)驗, (1)參考文獻(xiàn):對于一個科學(xué)研究者,可以直接找到研究物種已發(fā)表的基因組文獻(xiàn),一般情況下,文章會提供基因...

  • hifiasm軟件安裝與使用

    HiFi測序以及hifiasm軟件的使用,目前是市場上二倍體動植物基因組組裝的最佳選擇,沒有之一,多倍體目前也是最佳選擇,也正因為HiFi跟hifiasm軟件,使得動植物基因...

  • linux系統(tǒng)-界面配色分享

    在linux系統(tǒng)創(chuàng)建新的賬號后,界面顯示基本上是黑白色的,這時需要添加顯示的色彩,小編這里分享自己的界面配色: 將下面兩行添加到~/.bashrc 若有侵權(quán),聯(lián)系刪除

  • IBD分析軟件germline安裝與使用

    Identity by Descent (IBD) :同源相同片段,是在兩個及以上個體存在來源于同一祖先的、未發(fā)生重組的、完全相同的DNA片段,這樣的片段即為IBD片段,詳情...

  • @05466c253c6d 我的就是雙端,對著操作,后邊有一個樣本對應(yīng)雙端的表格

    原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)

    經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中,編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI,要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗的不要慌,小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI (一)NCBI賬號:上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...

  • 藍(lán)色至少寫一列,并且至少一列名稱需要不一樣,艷樣本名沒有問題

    原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)

    經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中,編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI,要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗的不要慌,小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI (一)NCBI賬號:上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...

  • 生信有感

    最近在嘗試GCC的安裝,嘗試了好幾次都以失敗告終,深感生信系統(tǒng)環(huán)境問題的重要性,總想用一篇牢騷文章來表達(dá)自己的感觸。偶然間,某鄭同學(xué),一語點破天才小編的感觸: 生信分析中,最...

  • 官網(wǎng)有解釋的

    線粒體組裝軟件Mitofinder安裝與使用

    下載與安裝如下,官網(wǎng)https://github.com/RemiAllio/MitoFinder[https://github.com/RemiAllio/MitoFind...

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    CNCB原始數(shù)據(jù)下載

    CNCB(China National Center for Bioinformation,國家生物信息中心),對標(biāo)的NCBI,對國內(nèi)研究者來說,數(shù)據(jù)上傳跟下載方便的多,現(xiàn)在...

  • NCBI原始SRA數(shù)據(jù)下載

    下載NCBI數(shù)據(jù),使用ascp命令是最快的,但是小編之前嘗試用該命令下載SRA數(shù)據(jù),查閱了百度上的各種參數(shù),最后還是沒有成功,可能是有個“墻”存在的原因,小編后來有一段時間使...

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