https://www.datacamp.com/community/tutorials/pca-analysis-r[https://www.datacamp.com/co...
發(fā)簡信
IP屬地：四川
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最后一句話深有體會，先寫再磨。
遇到對的審稿人，再簡單的純生信都可以發(fā)
有人說純生信不好發(fā)，只是你沒有選擇合適的期刊和遇到對的審稿人。只要選擇的期刊合適了，遇到了對的審稿人，純生信的內(nèi)容不需要很復(fù)雜，不用整什么列線圖、森林圖、ROC曲線之類也一樣...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繪制PCA圖以及生物學(xué)重復(fù)的相關(guān)問題
很久沒有跟新啦~~~忙著基金。?；稹?。還是基金，然后就是文章。。文章。。還是文章。終于有空整理之前的東西。 說繪圖方法之前先要了解，轉(zhuǎn)錄組的PCA圖的意義是什么？為了檢測樣...
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R 穩(wěn)健PCA分析穩(wěn)健PCA，就是一種通過構(gòu)造穩(wěn)健的均值向量和穩(wěn)健的協(xié)方差矩陣的主成分分析方法，其目標(biāo)是從輸入矩陣中去除稀疏缺失并獲得低秩近似，可以有效消除數(shù)據(jù)集中異常值的影響和提高尋找大型數(shù)...
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【R>>ssGSEA】制作GSEA需要的gmt文件GSEA文件有8類基因集，基本上可以解決80%-90%用到的問題，當(dāng)然，我們都還有個(gè)性化需求，這個(gè)時(shí)候就需要我們自己動手啦。先來觀察下GSEA需要的gmt文件格式(h.all...
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NBIS系列單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)匯總Single cell RNA-seq analysis workshop 該系列課程由瑞典國家生物信息學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施(NBIS) 負(fù)責(zé)設(shè)置，為瑞典Phd學(xué)生，博士后，研究人員和...
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學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
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RNA-Seq：差異表達(dá)分析案例白利合子酵母菌在乙酸或銅脅迫下早期反應(yīng)的轉(zhuǎn)錄譜分析 摘要：醋酸在食品工業(yè)和生物技術(shù)中是非常重要的微生物抑制化合物，而非傳統(tǒng)酵母種白利合子酵母菌對醋酸有顯著的耐受性。Zbhaa...
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非模式藍(lán)細(xì)菌物種注釋包構(gòu)建更新于2021.4.9又寫了一個(gè)script，用來一次性構(gòu)建多個(gè)物種包的。成功倒是成功了，就是可能效率比較低。主要是用了for循環(huán)，然后用列表分別存儲各自物種的數(shù)據(jù)的?？赡苓€...
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R|可視化|morris配色William Morris的方案按照世界名畫的配色進(jìn)行選取，特別適合在sci文章中進(jìn)行展示。 安裝[#%E5%AE%89%E8%A3%85] 所有的顏色都用magick和i...
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R包做主成分分析（含實(shí)例）注：內(nèi)容非原創(chuàng)，來自對網(wǎng)站http://www.sthda.com/english/articles/31-principal-component-methods-in-r-...
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fasta/fq文件處理萬能工具——Seqkit學(xué)習(xí)記錄
shenwei爪哥開發(fā)的處理Fasta/Fastq文件的萬能工具。之前處理fq/fa文件時(shí)花時(shí)間寫的一些腳本發(fā)現(xiàn)在seqkit里直接能一行命令就解決。實(shí)在是提升效率，整合流程...
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相關(guān)性分析 | R語言 -- 相關(guān)性矩陣及可視化感謝各位簡友一直的關(guān)注。 請關(guān)注：感謝陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891&...
