發(fā)簡信
IP屬地：內蒙古
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2019-08-29內容
基因組拼接 基因組Survey：基因組大小、雜合度、重復序列含量評估 拼接策略制定：二代、三代、Hi-C等 拼接原理 拼接軟件：SOAPdeno...
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STAMP
STAMP是對兩組或多組樣本在任何分類水平進行顯著性差異分析的軟件包，包括物種和功能差異分析。 兩組分析時，統(tǒng)計檢驗（Statistical t...
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K-mer分析常用工具
JELLYFISH KmerGenie GCE
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Teosinte ligule allele narrows plant architecture and enhances high-density maize yieldsTeosinte ligule等位基因縮小植物結構并增強高密度玉米產(chǎn)量 減少空間，但玉米產(chǎn)量更高。為了滿足日益增長的食品需求，現(xiàn)代農業(yè)的種植日益...
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NG-meta-profiler
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/367755v1.article-infoNG-meta-pro...
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prefetch 使用
sra數(shù)據(jù)會下載到家目錄下的ncbi/public/sra中，perfetch 默認aspera下載（如果存在于環(huán)境變量，否則使用https下載...
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Python處理fa文件的1/N種嘗試
Part1 ：計算fasta的序列的長度建立一個測試文件 注意點：line.rstrip() 去掉換行吧符，因為不去掉換行符，在文本文件里，換行...
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列表
目的：降低對AKW SED GREP的依賴定義列表是包含有索引的元素集，元素可由字符、數(shù)字、字符串及子列表組成，用 list = []表示。 基...
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列表 元組
列表 定義：列表是包含有索引的元素集，元素可由字符、數(shù)字、字符串及子列表組成，用 list = []表示。 元組 定義： 元組類似列表，只是元組...