說到deeptools，[https://www.baidu.com/link?url=6F9PeldteljlCkBMSOkg1_W9oDlmyJQvYqxFSPXmN5h...
發(fā)簡信
IP屬地：內(nèi)蒙古
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deeptools？還可以這么用！ -
nPerm = x，數(shù)字調(diào)大
關(guān)于GSEA富集結(jié)果條目數(shù)一跑一變的迷思和恍然大悟
當只有自己發(fā)生狀況時，歸結(jié)給運氣和自己太菜；當別人發(fā)生同樣的狀況時，歸結(jié)給共同的客觀原因，比如網(wǎng)速太慢、電腦太爛；當偉大的互聯(lián)網(wǎng)告訴你有更多的人遭遇了同樣的困惑，才終于投向科...
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沒用過GSEA軟件，R里面可以用fgsea這個包，至于得到的結(jié)果是不是像clusterProfiler這樣每次都不一樣，我也不清楚...clusterProfiler似乎是調(diào)用了fgsea，這兩個應(yīng)該是一樣的
關(guān)于GSEA富集結(jié)果條目數(shù)一跑一變的迷思和恍然大悟
當只有自己發(fā)生狀況時，歸結(jié)給運氣和自己太菜；當別人發(fā)生同樣的狀況時，歸結(jié)給共同的客觀原因，比如網(wǎng)速太慢、電腦太爛；當偉大的互聯(lián)網(wǎng)告訴你有更多的人遭遇了同樣的困惑，才終于投向科...
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我自己寫的，沒發(fā)布，沒有網(wǎng)址
基于神包clusterProfiler的ID轉(zhuǎn)換+MSigDb+KEGG分析的shiny小工具
啥也不懂，啥也不問 就放個ui代碼吧 用DOSE的內(nèi)置數(shù)據(jù)寫出為.txt后重新讀入 點一下 但發(fā)現(xiàn)一個問題： 設(shè)置圖片儲存路徑后，*.pathview.png還是在工作路徑中...
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SSH 遠程登錄 WSL飽受 Teamviewer/向日葵 之苦后，還是決定操作一番 安裝 openssh-server 修改 sshd_config 文件 PasswordAuthenticati...
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bedtools shuffle 迷思bedtools shuffle 的目的是保持每個 interval 的總長，隨機變換所有 inerval 的位置，結(jié)果可以作為一種隨機背景。-chrom 參數(shù)將隨機重分配限...
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使用 Python 把多個 MP4 合成一個視頻
這兩天群里有個小伙伴有一個需求, 就是把很多個視頻文件 合并成一個. 期間也找了各種軟件, 如格式工廠, 但是只能一次合成50個文件, 小伙伴有幾千個文件需要合成, 太繁瑣;...
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rawdata 有數(shù)字的部分提取出來，轉(zhuǎn)換成matirx
菜??日記-轉(zhuǎn)錄組edgeR分析差異基因及案例演示
菜??的第一次正式上手R，相當于翻譯了 edgeR 這個包的 UserGuide，跑了第一個 case眼看寫了這么多字，還是發(fā)一下比較好，萬一有人看呢 edgeR簡介 edge...
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@要快樂_更要經(jīng)歷山河 不一定噢，看看你的序列的 object 性質(zhì)
biomaRt: 用R愉快檢索BioMart數(shù)據(jù)庫
網(wǎng)速慢的原因找到了 R 與 BioMart 數(shù)據(jù)庫的語言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney E, Huber W (20...
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@膩歪_0bb5 當時應(yīng)該是3.6或3.7，不是很老的版本應(yīng)該都可以把
不出Rstudio, 實現(xiàn)從多序列比對到畫進化樹
本文是對前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包，從此不用再為序列比對東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包：biomaRt ，選擇用sym...
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@bluebluesk_0288 這個....沒有前因后果單這一句報錯我是看不出問題所在的...
R包安利 ① easyPubMed—PubMed利器
想讓這張圖當封面 1.1 關(guān)于 easyPubMed 作者是 Damiano Fantini ，2019-03-29 發(fā)表，甩鏈接。 看它的 Title: 搜索和讀取 Pub...
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都寫了是權(quán)限問題.....后發(fā)現(xiàn)win 10 ubuntu子系統(tǒng)有特殊的文件訪問方法
當 Salmon 構(gòu)建 index 秒失敗時應(yīng)該反思哪里
操作環(huán)境：Win10 Ubuntu子系統(tǒng) 1. 下載參考轉(zhuǎn)錄組 下載傳送門：http://ftp.ensembl.org/pub/release-76/fasta/homo_...
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函數(shù)參數(shù)里可以選的（印象中
不出Rstudio, 實現(xiàn)從多序列比對到畫進化樹
本文是對前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包，從此不用再為序列比對東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包：biomaRt ，選擇用sym...
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ConsensusClusterPlus 所有圖會出現(xiàn)在工作路徑的文件夾里
ConsensusClusterPlus: R中實現(xiàn)鑒定簇集數(shù)及其成員的算法
無監(jiān)督分析下鑒定簇集數(shù)及成員 Wilkerson, D. M, Hayes, Neil D (2010). “ConsensusClusterPlus: a class di...
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哈哈哈哈哪個坑，我忘了已經(jīng)
biomaRt: 用R愉快檢索BioMart數(shù)據(jù)庫
網(wǎng)速慢的原因找到了 R 與 BioMart 數(shù)據(jù)庫的語言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney E, Huber W (20...
