寫(xiě)在前面：在基因家族生信分析（二）這篇文章里，簡(jiǎn)單提到了一種基因結(jié)構(gòu)繪制的方法，當(dāng)時(shí)是跟著視頻課做筆記，沒(méi)有實(shí)際操作。直到今天實(shí)際操作了一下，發(fā)現(xiàn)有很多需要注意的地方，今天就...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：甘肅
-
保姆級(jí)教程：手把手教你畫(huà)出內(nèi)容豐富的基因結(jié)構(gòu)圖 （進(jìn)化樹(shù)+CDD+UTR/CDS） -
過(guò)表達(dá)載體合成步驟本文將介紹骨架載體+目的基因序列合成方法 在合成之前，應(yīng)該先確定骨架載體backbone+基因序列。其中，骨架載體是根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需要來(lái)決定。 一：目的基因獲取 在進(jìn)行PCR...
-
qRT-PCR 計(jì)算公式2–ΔΔCT (Livak) 方法當(dāng)我們做到熒光定量實(shí)驗(yàn)時(shí)候，普遍采用操作簡(jiǎn)便的2–ΔΔCT 法。 前提條件： 1. 使用2–ΔΔCT 法之前，必須驗(yàn)證目標(biāo)基因和參照基因的擴(kuò)增效率。目標(biāo)基因和參照基因擴(kuò)增效率...
-
190926【R語(yǔ)言作圖】實(shí)時(shí)定量PCR(RT_PCR)① 輸入ct值，直接導(dǎo)出帶誤差線的柱狀圖。② 使用到的R包，"pcr",官方包的安裝和使用教程詳見(jiàn)：https://www.rdocumentation.org/packag...
-
Origin科研繪圖前言 入了生物學(xué)的坑，狗狗們需要時(shí)不時(shí)的畫(huà)一些圖，看著別人高大上的圖片，大家有沒(méi)有好奇這些圖片是怎么做出來(lái)的呢? 就本狗狗來(lái)看(狗狗可能來(lái)自農(nóng)村-_-,)，現(xiàn)在鋪天蓋地的pa...
-
如何快速找到實(shí)驗(yàn)中的Protocol
做實(shí)驗(yàn)就像做菜，都可以按著protocol一步一步來(lái)，雖然不同人、不同時(shí)間做出來(lái)的結(jié)果參差不齊，不過(guò)有protocol在手總歸是安心一些。氮素，做菜的protocol可以問(wèn)度...
-
qRT-PCR相對(duì)定量計(jì)算詳解做完轉(zhuǎn)錄組分析之后，一般都要求做qRT-PCR來(lái)驗(yàn)證二代測(cè)序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠。熒光定量PCR是一種相對(duì)表達(dá)定量的方法，他的計(jì)算方法有很多，常用的相對(duì)定量數(shù)據(jù)分析方法有...
-
GTF文件讀取
GTF簡(jiǎn)介 GTF文件的全稱(chēng)是gene transfer format，主要是對(duì)染色體上的基因進(jìn)行標(biāo)注。怎么理解呢，其實(shí)所謂的基因名，基因座等，都只是后來(lái)人們給一段DNA序列...
-
RNAseq常規(guī)流程轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個(gè)基礎(chǔ)和常見(jiàn)的分析流程，一般從下機(jī)數(shù)據(jù)開(kāi)始，經(jīng)過(guò)一系列的質(zhì)控，基因組比對(duì)，差異分析等過(guò)程得到實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組（或者腫瘤中的轉(zhuǎn)移組和原癌組）中差異表達(dá)的基...
