你好請(qǐng)問(wèn)一下，我的數(shù)據(jù)不適合用Albacore，但是guppy有一個(gè)這樣的報(bào)錯(cuò)Unexpected token '--fast5_out' on command-line. 好像是guppy不支持這個(gè)參數(shù)了，請(qǐng)問(wèn)您有了解嗎？我的命令是這樣：guppy_basecaller -i all_single_fast5/
-s 02_output_single_fast5/ --flowcell FLO-PRO002 --kit SQK-LSK109 --fast5_out on --num_callers 8 --cpu_threads_per_caller 8 &
三代ONT甲基化相關(guān)分析軟件一、deepmod 1、三代測(cè)序得到的fast5文件是muti fast5，一個(gè)fast5文件里面有4000條fast5序列，deepmod不支持muti fast5，需要拆...
一、deepmod 1、三代測(cè)序得到的fast5文件是muti fast5，一個(gè)fast5文件里面有4000條fast5序列，deepmod不支持muti fast5，需要拆...
看到這個(gè)問(wèn)題，你可能搜了好多答案，比如 熱圖如何去掉聚類樹的同時(shí)保留聚類的順序？ - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/e...
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開始自學(xué)生物信息，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
基因組中重復(fù)序列大體分為兩類：串聯(lián)重復(fù)（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可預(yù)測(cè)）散在重復(fù)（Dispersed repeats），...
gemoma是根據(jù)已知參考基因組的注釋，給未知基因組注釋的軟件，貌似網(wǎng)上僅僅有提到，卻沒有具體的用法，筆者研究了一下，寫下以下傻瓜式攻略，給大家參考安裝很簡(jiǎn)單，直接用cond...
報(bào)錯(cuò)：The most common problem is an expired or not present file ~/.gm_key! 原因：這個(gè)報(bào)錯(cuò)比較寬泛，不唯一...
Differential gene expression analysis：差異表達(dá)基因分析 Differentially expressed gene (DEG)：差異表達(dá)...
任務(wù) 1.實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多，還是煩請(qǐng)大家先自己搜索幾個(gè)教程，入門請(qǐng)統(tǒng)一用htseq-count，對(duì)每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件。2.需要用腳本合并所有的樣本為表達(dá)矩...
傳送門： RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5)：序列比對(duì)RNAseq004 轉(zhuǎn)錄組入門(4)：參考基因組下載RNAseq003 轉(zhuǎn)錄組入門(3)：了解fastq測(cè)序數(shù)據(jù)RNA...
