問(wèn)題1：使用snippy用于fasta序列的文件SNP calling。發(fā)現(xiàn)結(jié)果中core.full.aln中，有開(kāi)頭100bp和結(jié)尾的100bp被標(biāo)記為NN >JN5803...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
-
[snippy]使用時(shí)遇到的問(wèn)題和困惑
-
隨筆 | 學(xué)會(huì)「獨(dú)處」
剛與一師兄聊了幾句，大體關(guān)于說(shuō)話(huà)做事。說(shuō)得直白點(diǎn)，或許就是「學(xué)會(huì)隱藏自己的想法」。這大半年過(guò)去，我不時(shí)也會(huì)與朋友聊到相關(guān)話(huà)題。世事無(wú)常，大多人與物并不以我們意志為轉(zhuǎn)移。事實(shí)上...
-
mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemRNA-seq上中游分析需要用到Linux系統(tǒng)的terminal！ 盡管TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中已經(jīng)提供了大量的處理好的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)，但是無(wú)論是自身實(shí)驗(yàn)需要，還是從NCBI的GEO...
-
qPCR | 熒光定量？批量設(shè)計(jì)引物，一鍵搞定！寫(xiě)在前面 Emmm，轉(zhuǎn)錄組篩了十來(lái)個(gè)基因，想著擴(kuò)大材料看看表達(dá)模式是否與數(shù)據(jù)體現(xiàn)相符，于是需要設(shè)計(jì)一下qPCR引物。當(dāng)然，自然是有一些軟件可以使用，但用起來(lái)不太方便。至少問(wèn)了...
-
Resfinder一鍵安裝以及問(wèn)題解決
準(zhǔn)備工作1.安裝好conda以及mamba2.建立一個(gè)環(huán)境，命名為resfinderconda create -n resfinder激活環(huán)境source activate ...
-
win11下Ubuntu子系統(tǒng)遷移D盤(pán)歷程以及遇到的問(wèn)題由于C盤(pán)快爆滿(mǎn)，將子系統(tǒng)遷移至D盤(pán)。直接用系統(tǒng)自帶的命令進(jìn)行遷移。右鍵開(kāi)始圖標(biāo)，打開(kāi)Powershell。 輸入以下命令： 顯示你當(dāng)前安裝的子系統(tǒng)，我只有一個(gè)"Ubuntu"...
-
使用clusterprofiler中的enrichr對(duì)非模式植物進(jìn)行KEGG分析一、需要的數(shù)據(jù) （1）eggnog對(duì)基因的注釋(名字例如叫:egg.tsv) TSV格式 （2）ko00001.json文件 下載地址：https://www.genome....
-
插件 | 給一堆「doi」，出一堆「論文.pdf」寫(xiě)在前面 最近給研究生師弟師妹講一門(mén)名為「園藝植物生物信息學(xué)實(shí)踐」的選修課... 計(jì)劃10~30人，估摸系統(tǒng)出了問(wèn)題，最終選了 44 人。盡管我盡可能勸退，但仍然有 68+ ...
-
E. coli ST1193比較基因組文章 標(biāo)題：Phylogenetic Analysis Reveals Distinct Evolutionary Trajectories of the Fluoroqui...
