IP屬地：江蘇
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“Simplicity is the ultimate sophistication.”
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個人學習生信的一點心得 歡迎討論指摘
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一些生物信息學用到的軟件，工具，介紹用法安裝以及以及應用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對比如mega、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進化樹構建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結構變異或者SNP序列GATK、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測序質量評估的FastQC、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
