二項(xiàng)分布和泊松分布都描述的是事件成功次數(shù)的分布，泊松分布是二項(xiàng)分布的極限分布，其適用條件是n很大，p很小的情況。生物學(xué)中一些過(guò)程可以使用二項(xiàng)分布或者泊松分布來(lái)模擬。 1. 使...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：新疆
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使用泊松分布判定chipseq的蛋白結(jié)合位點(diǎn)
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使用viz-palette可視化你的配色方案
數(shù)據(jù)分析時(shí)我們經(jīng)常會(huì)遇到多組treatment和control，多個(gè)細(xì)胞系，多種組學(xué)數(shù)據(jù)類型的情況，用ggplot或者matplotlib作圖時(shí)就要頭疼選顏色的問(wèn)題，這里有一...
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R語(yǔ)言 | 用image函數(shù)繪制熱圖heatmapR語(yǔ)言中繪制熱圖heatmap的包（package）有很多，除了許多炫酷的第三方包外，系統(tǒng)自帶的image函數(shù)使用起來(lái)也十分方便靈活。 1.主要繪制參數(shù) 2.繪制常規(guī)heat...
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RegulomeDB和HaploReg數(shù)據(jù)庫(kù)：后GWAS時(shí)代的數(shù)據(jù)整合
RegulomeDB和HaploReg數(shù)據(jù)庫(kù)提供了將大量基因組學(xué)數(shù)據(jù)與非編碼突變整合的思路。 1.背景 GWAS研究產(chǎn)生了大量的SNP，大部分在非編碼基因組 這些SNP其實(shí)是...
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使用REST API批量下載ENCODE數(shù)據(jù)本篇主要內(nèi)容 本篇主要介紹兩種方法，搜索并批量下載ENCODE數(shù)據(jù)。 方法一：在頁(yè)面中搜索并獲取下載地址 進(jìn)入ENCODE portal主頁(yè)：https://www.enco...
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玩轉(zhuǎn)ENCODE項(xiàng)目的數(shù)據(jù)資源（一）
本系列主要內(nèi)容 介紹ENCODE的數(shù)據(jù)概況，在data portal上查詢數(shù)據(jù)，使用REST API批量下載數(shù)據(jù)，參照ENCODE官方數(shù)據(jù)處理流程構(gòu)建自己的pipeline。...
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玩轉(zhuǎn)ENCODE項(xiàng)目的數(shù)據(jù)資源（一）本系列主要內(nèi)容 介紹ENCODE的數(shù)據(jù)概況，在data portal上查詢數(shù)據(jù)，使用REST API批量下載數(shù)據(jù)，參照ENCODE官方數(shù)據(jù)處理流程構(gòu)建自己的pipeline。...
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哈哈 謝謝！一起進(jìn)步
基因組學(xué)數(shù)據(jù)分析常用的在線資源
奮斗在人類組學(xué)數(shù)據(jù)分析的一線，要隨時(shí)跟上最新的研究進(jìn)展。大型的研究項(xiàng)目會(huì)有全面的數(shù)據(jù)集和可視化工具，也有專門從各個(gè)數(shù)據(jù)源收集數(shù)據(jù)整合而成的數(shù)據(jù)庫(kù)。手頭備幾個(gè)，方便查閱。 Ge...
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基因組學(xué)數(shù)據(jù)分析常用的在線資源
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用戶體驗(yàn)設(shè)計(jì)師，專欄作家?！鞠雽W(xué)習(xí)交互的小伙伴可以加微信：uesuozhang】
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理想與現(xiàn)實(shí)共存的雙重人格。輕微人格分裂。電影偏執(zhí)狂~<br>歡迎關(guān)注公眾號(hào)：「與Winter的五百天」<br>我已加入“維權(quán)騎士”(<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Frightknights.com" target="_blank">http://rightknights.com</a>)的版權(quán)保護(hù)計(jì)劃。<br>如需轉(zhuǎn)載，請(qǐng)點(diǎn)擊<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Frightknights.com%2Fmaterial%2Fauthor%3Fid%3D41215" target="_blank">https://rightknights.com/material/author?id=41215</a>
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Hi，很高興在@IT·互聯(lián)網(wǎng)專題遇見(jiàn)你。 收錄范圍：收錄IT&互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)觀察與思考，數(shù)碼產(chǎn)品極客體驗(yàn)分析等類型文章 投稿須知：http://www.itdecent.cn/p/4edc76104c27 專題主編：@若錦 http://www.itdecent.cn/u/e4c63b354a77 官方社群：可聯(lián)系添加 @若錦 加入專題官方社群交流、學(xué)習(xí)，添加時(shí)備注簡(jiǎn)書ID。
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生物信息學(xué)軟件，perl、python、R、shell腳本交流分享
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生信技能樹：https://vip.biotrainee.com/ Openbiox： https://community.openbiox.org/ 公眾號(hào)：優(yōu)雅R 生物數(shù)據(jù)分析QA，技術(shù)文檔與博客，需要你的參與。 ……………………………… 歡迎在簡(jiǎn)書創(chuàng)作和做筆記的生信學(xué)習(xí)者、愛(ài)好者以及相關(guān)編程人員加入本專題，貢獻(xiàn)你的文字，無(wú)論是原創(chuàng)還是筆記，我們需要你，將本專題打造為生信知識(shí)寶庫(kù)、交流平臺(tái)。 內(nèi)容可以是對(duì)生物信息學(xué)與算法知識(shí)相關(guān)資源的收集、整理，以及原創(chuàng)筆記： * R * Python * Perl * Linux 工具與編程 * 繪圖 * 統(tǒng)計(jì) * 計(jì)算生物學(xué) * 各類算法 * 機(jī)器學(xué)習(xí)
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生物信息工程師的編程語(yǔ)言清單
作為一名生物信息“工程師”，日常的工作環(huán)境是基于Unix的計(jì)算機(jī)集群，因此最常用的就是shell腳本。它可以簡(jiǎn)單的處理數(shù)據(jù)，再加上迷你語(yǔ)言sed和awk，也能滿足日常需求了。...
