醫(yī)學(xué)博士，目前就職于國內(nèi)五大腫瘤治療中心，R語言愛好者，熱衷于真實(shí)世界研究及生物信息學(xué)分析，合作請(qǐng)私信。
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蛋白質(zhì)組學(xué)學(xué)習(xí)整理-研究方法概述-1轉(zhuǎn)發(fā)自http://crickcollege.com/news/167.html 領(lǐng)域的大牛Prof. Bernhard Kuster 基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué)（pr...
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蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、質(zhì)控與分析
1. 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與技術(shù)路線 (1) 常用流程 流程說明1.材料收集細(xì)胞、細(xì)胞上清、組織、血漿、血清、腦脊液、外泌體、尿液......2.定量技術(shù)蛋白組：iTRAQ/TMT、La...
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根據(jù)基因表達(dá)特征，進(jìn)行免疫、代謝、m6A、鐵死亡、EMT、自噬、轉(zhuǎn)錄因子、缺氧基因、RBP亞型分析。
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ggplot2繪制獨(dú)特的分面圖本節(jié)來介紹如何使用ggplot2自定義繪制分面并添加統(tǒng)計(jì)信息,以及單分面數(shù)據(jù)注釋 加載R包 繪制并排箱線圖 通常geom_boxplot函數(shù)繪制的箱線圖都是不帶誤差線的，在此...
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歸一化 （Normalization）、標(biāo)準(zhǔn)化 （Standardization）和中心化/零均值化 （Zero-centered）1 概念??歸一化：１）把數(shù)據(jù)變成(０，１)或者（1,1）之間的小數(shù)。主要是為了數(shù)據(jù)處理方便提出來的，把數(shù)據(jù)映射到0～1范圍之內(nèi)處理，更加便捷快速。２）把有量綱表達(dá)式變成無量...
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R語言繪圖基礎(chǔ)篇-PCA加置信圈此文內(nèi)容首發(fā)于微信公眾號(hào)：R語言搬運(yùn)工，關(guān)注公眾號(hào)瀏覽更多精彩內(nèi)容 **原文鏈接[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg3NDY2MDcyO...
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第二代測(cè)序—illumina測(cè)序原理陳巍學(xué)基因-illumina測(cè)序原理官方-illumina測(cè)序原理步驟：一、sample prep（樣本準(zhǔn)備）：基因文庫制備（一個(gè)基因組切斷再加接頭）二、cluster ge...
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社交恐懼癥和重度拖延癥，還有魚的記憶
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使用Snapgene拼接Sanger測(cè)序結(jié)果Snapgene6.0.2版本 Tools->Assembly Contigs->Import Sequences to Assemble->選擇要拼接序列的ab1文件->A...
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從統(tǒng)計(jì)學(xué)的角度理解RNA-seq這次是分享李婧翌團(tuán)隊(duì)的一篇綜述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...
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單細(xì)胞測(cè)序分析: Seurat 使用教程原文見Seurat - Guided Clustering Tutorial, Compiled: April 17, 2020 #1 Seurat安裝 #2 數(shù)據(jù)下載 Pe...
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單細(xì)胞測(cè)序-scRNA-seq數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化處理我們都知道，從數(shù)據(jù)質(zhì)控開始已經(jīng)進(jìn)入了scRNA分析階段，在這個(gè)階段開始測(cè)試代碼，進(jìn)行實(shí)操是很重要的。測(cè)試過程中出現(xiàn)的各種問題可能成為你學(xué)習(xí)路上的攔路虎。作圖丫為大家總結(jié)單細(xì)胞...
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day5-數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)思維導(dǎo)圖 今日作業(yè) 復(fù)習(xí)之前學(xué)的 復(fù)習(xí)列表 復(fù)習(xí)數(shù)據(jù)框 作業(yè) 備注 在《R語言入門與實(shí)踐》中,作者說道“盡量不使用attach()函數(shù)”，用$這樣代碼更清晰
