有人問miRNA靶基因如何預(yù)測的問題,鑒于自己也做過相關(guān)的分析,稍有點經(jīng)驗,總結(jié)記錄一下。 一、miranda預(yù)測 軟件安裝 測試example 再舉一例(個性化分析) mi...
有人問miRNA靶基因如何預(yù)測的問題,鑒于自己也做過相關(guān)的分析,稍有點經(jīng)驗,總結(jié)記錄一下。 一、miranda預(yù)測 軟件安裝 測試example 再舉一例(個性化分析) mi...
背景 feature 定義:基因組上對具有不同性質(zhì)區(qū)域的定義 (例如:gene/exon/intron/miRNA等)。 優(yōu)點:利于分類整理結(jié)果。 兩類測序bias 長度bi...
前言 ??今天來跟大家分享一個smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiology.net/]。這個流程是...
Emmm, 今天的主圖, 寫在前面 博士畢業(yè)論文中,使用的樣品包括: 不同的類型 / 或者說不同的組織 不同的時間 / 或者說時間序列所以,是一個多X多的設(shè)計。對于這類實驗設(shè)...
出發(fā)點: 源自Single cell RNA sequencing to dissect the molecular heterogeneity in lupus nephr...
目標 通常比對好的bam,如果需要重新比對,需要將文件轉(zhuǎn)成原始的測序文件的格式fastq。通過bedtools中的bamtofastq 能夠?qū)⑽募D(zhuǎn)成fastq bedtoo...
劉小澤寫于19.6.8之前最開始學(xué)習IGV的時候?qū)戇^兩篇推文,當時簡單做了了解,但有朋友說意猶未盡,嗯我也這么覺得,總覺得還是學(xué)的不夠。推薦閱讀:https://github...
Micro RNA參與許多的生命調(diào)節(jié)過程,是近十年來的一個研究重點。 這次介紹:1.small RNA建庫測序方法2.small RNA的生物信息學(xué)分析 表達量差異分析 聚類...
1. linux 學(xué)習:http://wiki.jikexueyuan.com/project/learn-linux-step-by-step/ 2.python:http...