可能是網(wǎng)絡(luò)原因?
利用massdatabase包提取物種KEGG通路與基因/化合物對(duì)應(yīng)信息最近手頭處理一批代謝組數(shù)據(jù), 想基于幾十個(gè)關(guān)鍵差異代謝物代謝物進(jìn)行下KEGG富集,能想到有兩種方式解決,一種常用方式就是基于MetaboAnalyst在線富集,另一種就是解析...
可能是網(wǎng)絡(luò)原因?
利用massdatabase包提取物種KEGG通路與基因/化合物對(duì)應(yīng)信息最近手頭處理一批代謝組數(shù)據(jù), 想基于幾十個(gè)關(guān)鍵差異代謝物代謝物進(jìn)行下KEGG富集,能想到有兩種方式解決,一種常用方式就是基于MetaboAnalyst在線富集,另一種就是解析...
ggplot2基礎(chǔ)(5)——配色與圖例 參考《R數(shù)據(jù)可視化手冊(cè)》、《R繪圖:一文了解ggplot2顏色的設(shè)置[https://zhuanlan.zhihu.com/p/148...
適用背景 之前寫了兩篇博客(四步完成單細(xì)胞數(shù)據(jù)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)流程分析-SCENIC/pySCENIC-2022-09-06[http://www.itdecent.cn/p/71...
halo
單細(xì)胞之軌跡分析-6:velocyto.R+Seurat軌跡分析系列: 單細(xì)胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 單細(xì)胞之軌跡分析-2:mono...
生信的時(shí)代即將結(jié)束
爛大街的純生信只要這樣打扮一下就可以得到期刊的青睞隨著純生信的發(fā)展,幾年前的套路已經(jīng)很難發(fā)表文章了,就像下面的這種套路文章: The Cancer Genome Atlas (TCGA) based m6A methylat...
hello,大家好,今天我們來分享一個(gè)做細(xì)胞通訊的分析軟件NicheNet,這個(gè)軟件最大特點(diǎn)就是預(yù)測(cè)配體活性,所以很多文章里都將NicheNet和cellphoneDB聯(lián)合使...
方法學(xué)前半部分 sample collection 6個(gè)配對(duì)sample:化療前VS 化療后 RNA extraction 1.細(xì)胞提取/溶解2.提取RNA:RNeasy K...
在 Linux 環(huán)境下工作的工程師,一定會(huì)對(duì)那些繁瑣的指令和參數(shù)命令行印象深刻吧。而且,可怕的不是繁瑣,而是需要大量重復(fù)輸入這些繁瑣的命令。 在 Linux 下我們有個(gè)別名命...
轉(zhuǎn)自:傳送門 痛點(diǎn) 平時(shí)我們?cè)趌inux環(huán)境下安裝軟件時(shí)會(huì)習(xí)慣的安裝在/usr/local/目錄下,shell腳本可能會(huì)存放在/usr/local/bin/ 目錄下,但是可能...
感謝各位簡(jiǎn)友一直的關(guān)注。 請(qǐng)關(guān)注:感謝陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891&...