可能是網(wǎng)絡(luò)原因？
利用massdatabase包提取物種KEGG通路與基因/化合物對(duì)應(yīng)信息最近手頭處理一批代謝組數(shù)據(jù), 想基于幾十個(gè)關(guān)鍵差異代謝物代謝物進(jìn)行下KEGG富集，能想到有兩種方式解決，一種常用方式就是基于MetaboAnalyst在線富集，另一種就是解析...
IP屬地：重慶
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ggplot2學(xué)習(xí)（五）ggplot2基礎(chǔ)（5）——配色與圖例 參考《R數(shù)據(jù)可視化手冊(cè)》、《R繪圖：一文了解ggplot2顏色的設(shè)置[https://zhuanlan.zhihu.com/p/148...
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SCENIC/pySCENIC分析補(bǔ)充+小鼠數(shù)據(jù)示例2022-12-14
適用背景 之前寫了兩篇博客（四步完成單細(xì)胞數(shù)據(jù)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)流程分析-SCENIC/pySCENIC-2022-09-06[http://www.itdecent.cn/p/71...
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這個(gè)世界流行離開，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
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halo
單細(xì)胞之軌跡分析-6：velocyto.R+Seurat
軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 單細(xì)胞之軌跡分析-2：mono...
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生信的時(shí)代即將結(jié)束
爛大街的純生信只要這樣打扮一下就可以得到期刊的青睞
隨著純生信的發(fā)展，幾年前的套路已經(jīng)很難發(fā)表文章了，就像下面的這種套路文章： The Cancer Genome Atlas (TCGA) based m6A methylat...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析之NicheNethello，大家好，今天我們來分享一個(gè)做細(xì)胞通訊的分析軟件NicheNet，這個(gè)軟件最大特點(diǎn)就是預(yù)測(cè)配體活性，所以很多文章里都將NicheNet和cellphoneDB聯(lián)合使...
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學(xué)習(xí) seurat
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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RNA-Seq analysis of peripheral blood mononuclear cells reveals unique transcriptional signatures ...
方法學(xué)前半部分 sample collection 6個(gè)配對(duì)sample：化療前VS 化療后 RNA extraction 1.細(xì)胞提取/溶解2.提取RNA：RNeasy K...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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10 個(gè)提高效率的 Linux 命令別名
在 Linux 環(huán)境下工作的工程師，一定會(huì)對(duì)那些繁瑣的指令和參數(shù)命令行印象深刻吧。而且，可怕的不是繁瑣，而是需要大量重復(fù)輸入這些繁瑣的命令。 在 Linux 下我們有個(gè)別名命...
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Linux修改PATH環(huán)境變量
轉(zhuǎn)自：傳送門 痛點(diǎn) 平時(shí)我們?cè)趌inux環(huán)境下安裝軟件時(shí)會(huì)習(xí)慣的安裝在/usr/local/目錄下，shell腳本可能會(huì)存放在/usr/local/bin/ 目錄下，但是可能...
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相關(guān)性分析 | R語(yǔ)言 -- 相關(guān)性矩陣及可視化感謝各位簡(jiǎn)友一直的關(guān)注。 請(qǐng)關(guān)注：感謝陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891&...
