使用susieR鑒定多個(gè)因果變異位點(diǎn)只需要兩個(gè)輸入文件,一個(gè)輸入文件是包含Zscore值的SNP位點(diǎn)(zscore.txt),另一個(gè)文件是LD matrix(LD.matri...
使用susieR鑒定多個(gè)因果變異位點(diǎn)只需要兩個(gè)輸入文件,一個(gè)輸入文件是包含Zscore值的SNP位點(diǎn)(zscore.txt),另一個(gè)文件是LD matrix(LD.matri...
之前教程提到過(guò)Metal是可以做Meta分析,除了Metal,PLINK也可以進(jìn)行Meta分析。命令如下所示: 輸入文件gwas1.plink文件如下所示: 輸出結(jié)果如下所示...
基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)是兩個(gè)不同的概念。一般而言,通過(guò)PLINK、GCTA等工具計(jì)算...
GWAS表型的標(biāo)準(zhǔn)化方法一般有Quantile normalization、Inverse rank normalization、Z-score normalization等...
GWAS:mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS) 分析mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通過(guò)對(duì)多個(gè)表型相似的GWAS summary結(jié)果進(jìn)行聯(lián)合分析,發(fā)現(xiàn)更多的表型相關(guān)基因座。以抑郁癥狀...
mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通過(guò)對(duì)多個(gè)表型相似的GWAS summary結(jié)果進(jìn)行聯(lián)合分析,發(fā)現(xiàn)更多的表型相關(guān)基因座。以抑郁癥狀...
1、scDRS的計(jì)算原理如下所示: 圖片來(lái)源:Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enrichment distingui...
LDSC 除了可以計(jì)算基因多效性、遺傳度、遺傳相關(guān)性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQzMQ==&mid=224748...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220522 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Single-nucleus chromatin accessibility profiling high...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220515 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Multi-ancestry genetic study of type 2 diabetes highl...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220508 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Plasma proteome analyses in individuals of European a...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220423 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Nonlinear control of transcription through enhancer–p...
圖片一直上傳失敗,需要看的親們請(qǐng)移步我的博客,同名:橙子牛奶糖
本周最新文獻(xiàn)速遞20220410本周最新文獻(xiàn)速遞20220410 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Mapping genomic loci implicates genes and synaptic bi...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220410 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Mapping genomic loci implicates genes and synaptic bi...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220327 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Genetic regulation of post-translational modification...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220313 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Prediction of histone post-translational modification...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220306 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Genome-wide analysis provides genetic evidence that A...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220227 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Genetic associations of protein-coding variants in hu...
本周最新文獻(xiàn)速遞20220123 一、精細(xì)解讀文獻(xiàn) 一 文獻(xiàn)題目: Multi-ancestry eQTL meta-analysis of human brain iden...