代碼確實(shí)有問題欸，每個(gè)基因都只出現(xiàn)一次突變
TCGA突變數(shù)據(jù)挖掘：把樣本整理為突變型或野生型一從TCGA下載突變信息 這里下載的是maf文件 二把樣本根據(jù)是否突變分為野生型和突變型 可以看到包含了突變基因和對應(yīng)的樣本 最后 感謝jimmy的生信技能樹團(tuán)隊(duì)！ 感謝導(dǎo)師...
發(fā)簡信
IP屬地：廣西壯族自治區(qū)
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后面的代碼是有問題的，篩選出來的每個(gè)基因只在一個(gè)樣本里有突變。這不對
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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轉(zhuǎn)錄組分析——一、工作目錄搭建及SRA文件下載一、準(zhǔn)備工作-目錄管理 一句命令同時(shí)創(chuàng)建多個(gè)同級別文件夾，規(guī)律存放，方便溯源幾個(gè)文件的作用分別為“軟件安裝，數(shù)據(jù)庫存放，流程搭建目錄，項(xiàng)目分析，數(shù)據(jù)備份” 二、數(shù)據(jù)下載 流程...
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@e0cb837cd5b9 我終于知道了?。?！需要把raw文件夾刪除！因?yàn)槟J(rèn)是有raw數(shù)據(jù)的
scCancer包：自動分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組利器
scCancer包是2020年 清華大學(xué)Jin Gu團(tuán)隊(duì)開發(fā)的一個(gè)專門用于分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的工具包。它集成了單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的基本流程(Seurat)，增添若干適合腫瘤數(shù)據(jù)...
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@sugarballer 你好，請問你現(xiàn)在找到解決的辦法了嗎？我試了很多方法還是同樣報(bào)錯(cuò)??
scCancer包：自動分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組利器
scCancer包是2020年 清華大學(xué)Jin Gu團(tuán)隊(duì)開發(fā)的一個(gè)專門用于分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的工具包。它集成了單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的基本流程(Seurat)，增添若干適合腫瘤數(shù)據(jù)...
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@黃宗偉_0c76 你好，目前我也還沒有打通這部分內(nèi)容??還在嘗試
scCancer包：自動分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組利器
scCancer包是2020年 清華大學(xué)Jin Gu團(tuán)隊(duì)開發(fā)的一個(gè)專門用于分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的工具包。它集成了單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的基本流程(Seurat)，增添若干適合腫瘤數(shù)據(jù)...
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你的barcode文件里面是不是包含多個(gè)樣本的信息？會不會是這個(gè)原因引起的（一個(gè)文件只能一個(gè)樣本）？ @黃宗偉_0c76
scCancer包：自動分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組利器
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單細(xì)胞36計(jì)
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分子模擬和基因組學(xué)大雜燴，我們是生物信息愛好者，開源，共享盡在生信雜談~ 請關(guān)注微信公眾號生信雜談（xiaoddrz）獲取更多原創(chuàng)精彩內(nèi)容！<br>若您只是做基因的可以通過右側(cè)文集篩選文章
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這個(gè)世界流行離開，但我們卻不擅長告別
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@小貝學(xué)生信 就是我只有filtered的三個(gè)文件，沒有raw文件；但是跑代碼還是會報(bào)錯(cuò)提示barcode文件缺失（實(shí)際上filtered文件夾里是有的），糾結(jié)在這個(gè)問題嗷
這幾天我似乎想明白了一些，會不會是因?yàn)檫@個(gè)barcode里面有兩種樣本呀？那我拆分一下，等我有空先試試哈scCancer包：自動分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組利器
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您好！看了您的代碼解析受益匪淺！我能咨詢您一個(gè)問題嗎？我只有filtered_feature_bc_matrix(~1w cells)數(shù)據(jù)，跑代碼會出現(xiàn)報(bào)錯(cuò):Barcode file mising.不知如何解決？您能幫忙看看嗎？感激不盡！??
scCancer包：自動分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組利器
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