請(qǐng)問GWAS CATLOG的數(shù)據(jù)也都是UKB的數(shù)據(jù)嗎，我一直以為它是獨(dú)立的數(shù)據(jù)庫
孟德爾隨機(jī)UKB和芬蘭數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)獲取一般，孟德爾隨機(jī)會(huì)用UKB的數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練集，用芬蘭的數(shù)據(jù)庫作為驗(yàn)證集，如果想直接在R語言里面用在線的數(shù)據(jù)庫的話，可以直接用IEU數(shù)據(jù)庫（https://gwas.mrcieu...
老師，這套分析請(qǐng)問是否方便提供完整的分析思路，包括如何從那兩篇臨床試驗(yàn)提取概率矩陣等信息，想系統(tǒng)的學(xué)習(xí)下。
如何利用R語言進(jìn)行衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)的成本效果分析讀者朋友你們好啊，如果你關(guān)注過之前幾期公眾號(hào)（全哥的學(xué)習(xí)生涯）的內(nèi)容，你會(huì)知道我著重分享了如何利用R作meta分析的方法。而由于我本人研究方向的問題，今天這一期的內(nèi)容將以文末...
Markov模型的結(jié)局是不是只能是分類變量，如果是連續(xù)變量的話該怎么進(jìn)行成本效果分析呢
如何利用R語言進(jìn)行衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)的成本效果分析讀者朋友你們好啊，如果你關(guān)注過之前幾期公眾號(hào)（全哥的學(xué)習(xí)生涯）的內(nèi)容，你會(huì)知道我著重分享了如何利用R作meta分析的方法。而由于我本人研究方向的問題，今天這一期的內(nèi)容將以文末...
你好，請(qǐng)問ICD相關(guān)基因和lncRNA的相關(guān)性分析博主知道是怎么做的嗎，我看了下原文這一段沒有說明，是先把ICD相關(guān)基因整合成一個(gè)風(fēng)險(xiǎn)分?jǐn)?shù)嗎？
基于免疫原性細(xì)胞死亡相關(guān)lncRNA模型，預(yù)測(cè)抗腫瘤藥物靶點(diǎn)預(yù)后價(jià)值Prognostic value of antitumor drug targets prediction using integrated bioinformatic an...
另外想再請(qǐng)教一下，利用差異表達(dá)基因座fgsea的時(shí)候logFC>0和logFC<0的基因要分開分析嗎
fgsea單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組GSEA富集分析Gene Set Enrichment Analysis(GSEA),Subramanian et al. 20051[https://doi.org/10.1073/pna...
請(qǐng)問下作者運(yùn)行fgseaRes<- fgsea(fgsea_sets, stats = ranks, nperm = 1000)這一句的時(shí)候有沒有報(bào)很多warning信息，我的雖然正常出結(jié)果了但是有3條waring
fgsea單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組GSEA富集分析Gene Set Enrichment Analysis(GSEA),Subramanian et al. 20051[https://doi.org/10.1073/pna...
請(qǐng)問下scenic可以用windows系統(tǒng)的R跑 嗎，還是必須用服務(wù)器linux嗎
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析工具（TF，motifs）-SCENIC相信很多專題應(yīng)該已經(jīng)講過SCENIC的使用，這兒，針對(duì)我自己對(duì)SCENIC的學(xué)習(xí)使用，遇到的問題做一個(gè)詳細(xì)的講解說明，希望能對(duì)大家理解學(xué)習(xí)應(yīng)用SCENIC起到一些幫助。 SC...
請(qǐng)問下scenic可以用windows系統(tǒng)的R跑 嗎，還是必須用服務(wù)器linux的
SCENIC安裝踩坑教程一、官方提供的安裝方法 #詳細(xì)的安裝教程參考官網(wǎng) https://github.com/aertslab/SCENIC 安裝代碼如下 在安裝SCENIC之前，請(qǐng)按照以下代碼安...
請(qǐng)問下scenic可以用windows系統(tǒng)的R跑 嗎，還是必須用服務(wù)器linux
2019-08-28第七天：關(guān)于SCENIC的使用教程文章來源：scenic: single-cell regulatory network inference and clustering github 一、軟件安裝 安裝教程...
您好，想咨詢下新的熱點(diǎn)之類如何去探索呢，感覺每次都落后一步
發(fā)生信SCI的希望不應(yīng)該寄托在過去的熱點(diǎn)上自從生信利用熱點(diǎn)發(fā)SCI流行起來之后，現(xiàn)在各種各樣的熱點(diǎn)都被用來做生信了，只要有新熱點(diǎn)出來，肯定會(huì)被用來做生信；只要該熱點(diǎn)有一篇生信文章出來了，就會(huì)有越來越多人來模仿這篇文章...
cibersort可以自定義單細(xì)胞的基因集在tcga里預(yù)測(cè)嗎，這個(gè)好，我一直在找單細(xì)胞聚類聯(lián)系到bulk生存的方法
最近7.7分SCI，單細(xì)胞分析+WGCNA+實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，有實(shí)驗(yàn)條件者可輕易模仿，腫瘤非腫瘤均適合！發(fā)表雜志：Biological Procedures Online 影響因子：7.71 生信分析咨詢 請(qǐng)關(guān)注“生信小課堂”全網(wǎng)同名 研究背景： 結(jié)直腸癌(CRC)是全球癌癥相...
作者對(duì)單細(xì)胞測(cè)序了解的多嗎，最近看到篇nature的單細(xì)胞過濾標(biāo)準(zhǔn)很奇怪，他測(cè)的CD3，然后對(duì)線粒體和核糖體的過濾策略竟然是線粒體小于10%，核糖體大于10%，我是第一次看到選核糖體大于10%而不是壓低的
如何巧妙利用單細(xì)胞核糖體基因發(fā)NAR說在前面 相信很多小伙伴在分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)做差異基因分析時(shí)都有這樣的經(jīng)歷：發(fā)現(xiàn)往往差異最明顯的都是那些什么RPL/RPS打頭的核糖體基因。每當(dāng)這時(shí)很多人的第一反應(yīng)(小編也是這樣...
請(qǐng)問presto和findallmarkers有啥異同嗎，我看檢驗(yàn)方法應(yīng)該都是wilcox，有優(yōu)劣之分嗎
單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程單細(xì)胞GSEA分析需要的文件有兩個(gè)：1. 單細(xì)胞基因表達(dá)變化數(shù)據(jù)（兩列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目標(biāo)基因集（...
