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  • 大神,咱倆看的應(yīng)該是一個老師講課的視頻,那個pop文件是怎么搞的?自己做的嗎?

    群體結(jié)構(gòu)——PCA分析

    概念 PCA(principal components analysis)即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析,旨在利用降維的思想,把多指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個綜合指標(biāo)。 在統(tǒng)計...

  • 您好,plotQ的quiet=T提示參數(shù)不對,請問是怎么回事啊

    基于vcf文件進行Admixture群體結(jié)構(gòu)分析

    ADMIXTURE 是常用的群體遺傳學(xué)分析工具,可以估計個體的祖先成分。與 STRUCTURE 相比,它的速度更快。Admixture分析舉例: Admixture中群體的亞...

  • GWAS分析-說人話(14)- 如何查看SNP的基因型

    前言 這年頭,誰還TM的做GWAS~ 今天導(dǎo)師不是想和你看流星雨, 是想和你看看他感興趣SNPs在某個亞組數(shù)據(jù)中的基因型....... 怎么辦? I have 一堆SNPs,...

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    GWAS分析-說人話(3)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)下載后的處理

    前言 上天會告訴你那個文件才是需要用的嗎? 不會! 但我會?。c個贊,大個賞唄~) 數(shù)據(jù)下載后,相信我,小白連看哪個數(shù)據(jù)都會不知道的! 當(dāng)然,數(shù)據(jù)分析的第0章,數(shù)據(jù)下載,也不...

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    CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)簡介

    CRISPR-Cas9是繼ZFN、TALENs等基因編輯技術(shù)推出后的第三代基因編輯技術(shù),短短幾年內(nèi),CRISPR-Cas9技術(shù)風(fēng)靡全球, 成為現(xiàn)有基因編輯和基因修飾里面效率最...

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    RNAseq常規(guī)流程

    轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個基礎(chǔ)和常見的分析流程,一般從下機數(shù)據(jù)開始,經(jīng)過一系列的質(zhì)控,基因組比對,差異分析等過程得到實驗組與對照組(或者腫瘤中的轉(zhuǎn)移組和原癌組)中差異表達(dá)的基...

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    生信分析學(xué)習(xí)筆記 - RNAseq (四) trimmomatic

    聲明:本文部分內(nèi)容和部分圖片來源于網(wǎng)絡(luò)。本文為生信小白學(xué)習(xí)筆記,不能保證專業(yè)名詞和內(nèi)容全部正確或權(quán)威。 下圖為某一條RNAseq從數(shù)據(jù)預(yù)處理,序列回帖到數(shù)據(jù)可視化的工作流程,...

  • 您好,我是一名研一的生物學(xué)研究生,有讀博的打算,目前在自學(xué)Linux和python,也學(xué)習(xí)了一些轉(zhuǎn)錄組分析軟件和知識,想轉(zhuǎn)去生物信息學(xué)方向讀博,請問一下聯(lián)系導(dǎo)師的時候難度大嗎?研究生期間需要怎么準(zhǔn)備呢?謝謝

    使用TransDecoder尋找轉(zhuǎn)錄本中的編碼區(qū)

    TransDecoder能夠從轉(zhuǎn)錄本序列中鑒定候選編碼區(qū)。這些轉(zhuǎn)錄本序列可以來自于Trinity的從頭組裝,或者來自于Cufflinks或者StringTie的組裝結(jié)果。 軟...

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