tryCatch報錯后不退出，而是執(zhí)行error=后的自定義函數(shù)；出現(xiàn)警告則執(zhí)行warning =后的自定義函數(shù);finally=后的自定義函數(shù)總是執(zhí)行 例：
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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tryCatch錯誤處理
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影像組學(xué)radiomics學(xué)習(xí)筆記第三章（一）CT圖像包含的特征
影像組學(xué)即高通量地從醫(yī)學(xué)影像中挖掘圖像特征地過程。影像組學(xué)地功能工作流程包括：1）獲取圖像；2）分割感興趣的區(qū)域，例如腫瘤；3）定量地提取圖像特征；4）預(yù)測模型的建立和驗證。...
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一次性計算多個表型的遺傳相關(guān)性(LDSC, GCTA)
遺傳相關(guān)的計算之前介紹過幾次了，感興趣的翻之前的推文： 1、利用GCTA工具計算復(fù)雜性狀/特征（Complex Trait）的遺傳相關(guān)性（genetic correlatio...
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標(biāo)準(zhǔn)差與標(biāo)準(zhǔn)誤區(qū)別
有統(tǒng)計學(xué)教科書在講到“標(biāo)準(zhǔn)誤”時，寫下了這樣一句話——“樣本均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)誤是樣本均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差”！ 是的，你沒有看錯，就是這樣寫的——“樣本均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)誤是樣本均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差”！ 有...
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NHANES連載教程，輕松解鎖新技能
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別人利用生信發(fā)文章，而我利用它找課題“生信”這兩個字，，對于臨床醫(yī)生來說，還是比較熟悉的，有很多臨床醫(yī)生利用生信發(fā)了無數(shù)篇文章，有些臨床醫(yī)生可能還沒有接觸過生信，但是基本都聽說過生信，知道生信是可以發(fā)SCI論文...
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【生信實戰(zhàn)】只會GO/KEGG，何不試試Reactome數(shù)據(jù)庫進行富集分析REACTOME 是一個開源、放開、人工整理并經(jīng)過同行評審的通路數(shù)據(jù)庫。目標(biāo)是為各個通路提供可視化、可解釋的分析，以支持基礎(chǔ)研究、臨床研究、基因組分析、建模、系統(tǒng)生物學(xué)等。 ...
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孟德爾隨機化招學(xué)員啦
中山醫(yī)博士孟德爾隨機化全流程 感興趣的話私聊～ 授課老師（2人）情況： 均為中山醫(yī)博士，目前共發(fā)表孟德爾隨機化文章7篇，涵蓋雜志包括ebiomedicine，JTRM，Add...
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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貝葉斯共定位軟件coloc前言 這篇文章的書寫，是受啟發(fā)于《post-GWAS：使用coloc進行共定位分析(Colocalization)》，目的是想了解一下軟件coloc是如何巧妙的運用貝葉斯方法...
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BrainSeq | eQTL 不同腦區(qū) 精神疾病簡介 http://eqtl.brainseq.org/項目旨在描述主要神經(jīng)精神疾病和對照樣本中不同腦區(qū)域轉(zhuǎn)錄的多個方面的遺傳和表觀遺傳調(diào)控特征。該聯(lián)盟最初專注于精神分裂癥和...
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GWAS與基因表達量的聯(lián)合分析前言 我們知道GWAS描述的是snp與表型之間的關(guān)系，即利用線性模型尋找與某種性狀顯著相關(guān)聯(lián)的位點。但是發(fā)揮生物學(xué)功能的往往是蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)是由轉(zhuǎn)錄本翻譯而來，那么建立基因表...
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TWAS（fusion）最近在看遺傳數(shù)據(jù)與表達結(jié)合的東西，介紹一個經(jīng)典的方法吧，fusion。 Gusev et al. “Integrative approaches for large-scal...
