上一步驟(第6篇:重復(fù)樣本的處理——IDR)用IDR對(duì)重復(fù)樣本peaks的一致性進(jìn)行了評(píng)估,同時(shí)得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr,接下來(lái)就是對(duì)p...
上一步驟(第6篇:重復(fù)樣本的處理——IDR)用IDR對(duì)重復(fù)樣本peaks的一致性進(jìn)行了評(píng)估,同時(shí)得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr,接下來(lái)就是對(duì)p...
劉小澤寫(xiě)于18.12.25各種各樣的基因研究,總有那么些經(jīng)典的基因,如果不理解基因代表的生物學(xué)意義,那么做分析也是阻礙重重,所以,通過(guò)看文獻(xiàn)查資料,希望可以補(bǔ)一下這方面的背景...
今天就當(dāng)一個(gè)小故事看吧,看了statQuest,感覺(jué)講的很棒,于是分享給大家原版視頻后臺(tái)回復(fù)“RNAseq”??花花今天效率太低寫(xiě)不完推送,于是我從晚上10點(diǎn)半開(kāi)始幫她,有點(diǎn)緊...
轉(zhuǎn)自:http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=635619&do=blog&id=884213 用tophat和cu...
1 比對(duì)的是:使用idba_ud拼接的AER314-4raw_data基因組與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。 2 bowtie2做index(bowtie2使用conda安裝) 建索引:bow...
問(wèn)題 Paired-End測(cè)序與Mate-Pair測(cè)序相對(duì)于單端測(cè)序有何優(yōu)勢(shì)? Paired-End中的Read1和Read2到底是啥關(guān)系?它們是如何參與拼接和比對(duì)的呢? M...
fastq測(cè)序文件去除rRNA、mapping input(雙端測(cè)序) for i in UV_12h UV_2h WT_2h WT_12h ; do bowtie2 -x ...
我2017年用的域名失效了,我之前那個(gè)網(wǎng)站也沒(méi)用了,所以這篇文章之前提供的鏈接跳轉(zhuǎn)不過(guò)去。我現(xiàn)在直接在簡(jiǎn)書(shū)提供全文,然后新的鏈接是:https://www.shixiangw...