發(fā)簡信
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步驟1：數(shù)據(jù)質(zhì)控： fastp代碼如下，保存為fastp.sh 執(zhí)行fastp命令，批量處理fastq文件 步驟2：call SNP，使用GAT...
注意，region.xls和 final_sorted_with_promoter.change.gene文件均為bed格式。bed格式前3列為...
將當(dāng)前目錄下大于200Mb，且沒有壓縮的文件均壓縮 這個(gè)命令使用find命令來查找當(dāng)前目錄下大于200MB且不以".gz"結(jié)尾的文件。然后使用-...
如果你想替換特定的樣本名稱，你可以創(chuàng)建一個(gè)包含舊名稱和新名稱的文件，然后使用bcftools reheader命令進(jìn)行替換。這個(gè)文件的格式應(yīng)該是...
安裝 R 包agricolae報(bào)錯(cuò)：installation of package ‘a(chǎn)gricolae’ had non-zero exit ...
SnpSift 可以分割染色體，截取部分vcf文件。具體使用方法見：https://blog.csdn.net/weixin_43569478/...
awk '2<42767716 {print 4"\t"$5}' >R04_R4_1.vcf
import osimport xlwings as xw def excel2pdf(file):app = xw.App(visible=T...