一、背景介紹 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計(jì)：Bedtolols inter...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：伊利諾伊州
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Intervene: BED文件的intersect和繪制韋恩圖 -
CellChat：細(xì)胞間相互作用分析利器前言 我們知道，細(xì)胞間信息傳遞方式一個(gè)是細(xì)胞表面配受體的相互作用，另一個(gè)通過(guò)細(xì)胞產(chǎn)生的可溶性小分子，即細(xì)胞因子。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中下游，有時(shí)候我們想看某幾種細(xì)胞類(lèi)型之間的相互...
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解析 Ensembl 的數(shù)據(jù)庫(kù)服務(wù)器（圖文詳解）Ensembl 對(duì)于學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的我們來(lái)說(shuō)應(yīng)該是如數(shù)家珍了，但是我們平時(shí)常用到的操作一般是去查基因，下載基因組，這些都是通過(guò)網(wǎng)頁(yè)端來(lái)完成： http://uswest.en...
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單細(xì)胞分析的 Python 包 Scanpy（圖文詳解）一、安裝 Conda 安裝使用圖文詳解（2021版）[https://blog.csdn.net/u011262253/article/details/88828229] s...
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那令人困惑的比對(duì)工具選擇啊~
寫(xiě)在前面的廢話 我可能不適合做科研，因?yàn)槲铱偸菍?duì)一些“沒(méi)有必要”的事斤斤計(jì)較~ 剛開(kāi)始接觸二代測(cè)序時(shí)，是跟著Jimmy大神從RNA-seq開(kāi)始入門(mén)的。那時(shí)候使用的比對(duì)工具是H...
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Excel 做統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
數(shù)據(jù)分析插件 1、進(jìn)入 Excel 點(diǎn)擊選項(xiàng) 2、在加載項(xiàng)中點(diǎn)擊轉(zhuǎn)到 3、打開(kāi)分析工具庫(kù)擴(kuò)展 4、選擇數(shù)據(jù)標(biāo)簽頁(yè)，點(diǎn)擊數(shù)據(jù)分析 5、選擇適合數(shù)據(jù)的分析方法，這里以方差分析為例...
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三代測(cè)序（Nanopore）一、測(cè)序原理 先介紹 Nanopore 測(cè)序中的幾位主角： Reader ：在自然界中，有一種可以嵌入到細(xì)胞膜中作為離子或分子通道的跨膜蛋白，具有天然的蛋白納米孔。經(jīng)過(guò)人為基...
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Linux 遠(yuǎn)程復(fù)制文件和目錄
一、命令 格式：scp 文件/目錄路徑名 root@ip地址:文件/目錄路徑名 1、從遠(yuǎn)程服務(wù)器復(fù)制文件到本地 2、從本地文件復(fù)制到遠(yuǎn)程服務(wù)器 3、從遠(yuǎn)程服務(wù)器復(fù)制目錄到本地...
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一文讀懂 ChIPseq
一、介紹 ChIP-seq，測(cè)序方法ChIP 指染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP），seq 指的是二代測(cè)序方法 作用...
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Chip-seq分析流程以Targeting super-enhancer-associated oncogenesin oesophageal squamous cell carcinoma為例，...
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圖解統(tǒng)計(jì)學(xué) 01 | 神奇的正態(tài)分布正態(tài)分布介紹 這是在統(tǒng)計(jì)學(xué)中大名鼎鼎的一種分布，最早由德國(guó)的天文學(xué)家Moivre提出。 后來(lái)，德國(guó)數(shù)學(xué)家高斯（Gauss）首先將其應(yīng)用于天文學(xué)研究，故正態(tài)分布也叫“高斯分布”...
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