發(fā)簡信
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cellphonedb v5注意事項(xiàng)
安裝時(shí)出現(xiàn)報(bào)錯(cuò)： 原因： MACS2 2.2.7.1的requirement寫錯(cuò)了解決;去/usr/local/python3/lib/pyth...
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Scanpy中sc.tl.rank_genes_groups得到LFC為Nan錯(cuò)誤情況：出現(xiàn)Nan 根據(jù)https://github.com/scverse/scanpy/issues/653[https://github...
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畢業(yè)論文注意事項(xiàng)
如何讓tab首行縮進(jìn)為2個(gè)字符：https://zhidao.baidu.com/question/210792022.html[https:/...
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序列保守性分析及Seqlogo展示
步驟一：多序列比對 CSV與Fasta文件格式相互轉(zhuǎn)化[https://cdcgov.github.io/CSV2FASTA/] 序列比對在線網(wǎng)...
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在scanpy中選擇細(xì)胞
https://scselpy.readthedocs.io/en/latest/Tutorial.html[https://scselpy.r...
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bbknn僅對umap有效
今天試了一下在jupyter看pseudotime 在用Palantir和Cellrank的時(shí)候都出現(xiàn)了一個(gè)問題，就是批次效應(yīng)非常明顯，明明已經(jīng)...
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Adobe illustrator科研組圖學(xué)習(xí)筆記（針對Mac）
繪圖要求（以Cell為例） 畫板一般選擇“l(fā)etter” 字體使用Helvetica或Arial。 分辨率：彩圖≥300 dpi，黑白圖≥500...
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利用matplotlib保存圖片ref[https://blog.csdn.net/baidu_41798699/article/details/120267005] 一定要保...
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批量讀取cellranger以構(gòu)建adata
首先構(gòu)建一個(gè)dataframe，包含相關(guān)的metadata 讀取內(nèi)容包括轉(zhuǎn)錄組、TCR和Loom文件，注意看看TCR和轉(zhuǎn)錄組的barcode是否...