前言 胞葬作用（吞噬細(xì)胞清除程序性死亡的細(xì)胞）對控制腫瘤生長一定是有利的嗎？這可未必，最近剛發(fā)表在nature cancer上題為：Efferocytosis reprogr...
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弄巧成拙！清除損傷細(xì)胞的胞葬作用竟促進(jìn)了胰腺導(dǎo)管癌肝轉(zhuǎn)移 -
新型血液指標(biāo)能預(yù)測不同性別癌癥患者的免疫治療效果前言 抗 PD-1/PD-L1 和抗 CTLA-4 等免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICIs)的臨床應(yīng)用極大的改變了實(shí)體瘤的治療策略，特別是提高了惡性黑色素瘤(MM)和非小細(xì)胞肺癌 (N...
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Cell解讀｜可編程的反應(yīng)擴(kuò)散系統(tǒng)用于揭示細(xì)胞的時(shí)空信號前言 細(xì)胞的生命活動受多種蛋白質(zhì)的時(shí)空動態(tài)調(diào)控，這種動態(tài)組織和調(diào)控失衡會導(dǎo)致許多人類疾病，因此有必要認(rèn)識細(xì)胞中蛋白質(zhì)的時(shí)空組織和動態(tài)調(diào)控機(jī)理。目前，盡管一系列研究在這方面已經(jīng)...
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文獻(xiàn)解讀｜孕激素通過Id2/Pim1通路減弱Th 17細(xì)胞在自身免疫性葡萄膜炎中的致病性前言 自身免疫性葡萄膜炎（autoimmune uveitis，AU）是眼科最常見的自身免疫性疾?。╝utoimmune disease，AD）之一，具有病因復(fù)雜、發(fā)病率高、...
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如何做到一套單細(xì)胞數(shù)據(jù)發(fā)兩篇高分SCI？說在前面 Immugent最近偶遇一個(gè)很好的乳腺癌單細(xì)胞數(shù)據(jù)--GSE161529，于是就想拿出來分享給大家。不僅是因?yàn)檫@個(gè)數(shù)據(jù)囊括的乳腺癌類型很全，而是作者利用這一套數(shù)據(jù)發(fā)...
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一文說清楚衰老T細(xì)胞的研究進(jìn)展一、摘要 據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì)，目前全球大多數(shù)人的預(yù)期壽命均已達(dá)到60歲及以上；預(yù)計(jì)到2034年，老年人的數(shù)量將超過兒童；而到2050年，全球60歲及以上人口將達(dá)到21億人，其...
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OralExplorer：教你如何簡單制作自己的網(wǎng)頁工具前言 口腔炎癥(oral inflammatory disease)，指口腔軟組織和硬組織的感染，包括牙周炎、種植體周圍炎和齲齒。若不及時(shí)治療，可能會導(dǎo)致頜面部和系統(tǒng)部位的并...
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JCR1區(qū)！7.4分 單細(xì)胞聯(lián)合bulkRNAseq轉(zhuǎn)錄組+甲基化熱點(diǎn)+體內(nèi)體外機(jī)制驗(yàn)證，干濕結(jié)合典范!前言 今天給大家分享的文獻(xiàn)是2024年3月16日發(fā)表在“Journal of Translational Medicine”的一篇將干濕結(jié)合經(jīng)典的文章，題目是《Single-...
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重大進(jìn)展：Tfh細(xì)胞也有前體細(xì)胞啦前言 在生發(fā)中心（Germinal Center，GC）形成的過程中，濾泡輔助性T（T follicular helper，Tfh)細(xì)胞承擔(dān)著重要的角色。最初，科學(xué)家們基于其...
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tidyestimate：給免疫浸潤程度的評估提提速前言 還記得Immugent最開始做數(shù)據(jù)挖掘時(shí)，最常做的分析之一就是用ESTIMATE包來評估腫瘤組織的免疫浸潤情況，雖然得到的結(jié)果只有stromal score，immun...
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震驚！未成熟的NK細(xì)胞可以促進(jìn)三陰性乳腺癌的進(jìn)展前言 乳腺癌是女性最常見的腫瘤，是美國女性腫瘤相關(guān)死亡的第二大原因，據(jù)估計(jì)，2020年即有27.5萬多例新病例報(bào)告。三陰性乳腺癌（Triple-negative breast...
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babelgene：滿足你對基因互轉(zhuǎn)的所有想象
前言在日常分析中，我們經(jīng)常會遇到對同一物種基因ID和symbol之間的互轉(zhuǎn)，或者是不同物種之間同源基因的互轉(zhuǎn)。雖然目前已經(jīng)有幾個(gè)包，比如：biomaRt，easyConver...
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當(dāng)單細(xì)胞遇上LncRNA：實(shí)現(xiàn)非polyA轉(zhuǎn)錄本的捕獲LncRNA的概念及功能 LncRNA的概念 長鏈非編碼RNA（long non-coding RNA, LncRNA）是一類長度大于200nt但不編碼蛋白質(zhì)的非編碼RNA，...
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當(dāng)單細(xì)胞遇上circRNA：揭示其細(xì)胞功能調(diào)控的利器circRNA的概念及功能 circRNA的概念 環(huán)形RNA分子（Circular?RNAs，circRNAs）是一類特殊的非編碼RNA分子，主要是通過反向剪接機(jī)制產(chǎn)生，表現(xiàn)...
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生信數(shù)據(jù)挖掘+實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證 | 鑒定RECK基因?yàn)槲赴┑谋Ｗo(hù)性預(yù)后指標(biāo)和腫瘤抑制因子（抑制ERK/MAPK 信號通路）前言 據(jù)相關(guān)統(tǒng)計(jì)，胃癌 (GC) 在所有癌癥中的發(fā)生率位居第五位，相關(guān)死亡率排第四位。大多數(shù)GC患者在診斷時(shí)已處于晚期并發(fā)生腫瘤轉(zhuǎn)移，導(dǎo)致預(yù)后不佳，5年總生存率低于30%。因...
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當(dāng)單細(xì)胞遇上巨噬細(xì)胞：腫瘤免疫治療的新希望巨噬細(xì)胞簡介 1. 巨噬細(xì)胞的基本特征 巨噬細(xì)胞（Macrophages）是由骨髓造血干細(xì)胞衍生出的一種重要的免疫細(xì)胞，其是單核吞噬細(xì)胞系（Mononuclear Phago...
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EcoTyper代碼實(shí)操（六）：在預(yù)先分選細(xì)胞類型的數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)細(xì)胞狀態(tài)和生態(tài)型前言 EcoTyper是一個(gè)基于機(jī)器學(xué)習(xí)的工具，能夠從Bulk、單細(xì)胞、以及空間分辨率的基因表達(dá)數(shù)據(jù)中大規(guī)模地識別并驗(yàn)證細(xì)胞狀態(tài)和生態(tài)型。我們在前面的推文中介紹了EcoTyp...
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EcoTyper代碼實(shí)操（五）：在scRNA-seq數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)細(xì)胞狀態(tài)和生態(tài)型前言 EcoTyper是一個(gè)基于機(jī)器學(xué)習(xí)的工具，能夠從Bulk、單細(xì)胞、以及空間分辨率的基因表達(dá)數(shù)據(jù)中大規(guī)模地識別并驗(yàn)證細(xì)胞狀態(tài)和生態(tài)型。我們在前面的推文中介紹了EcoTyp...
