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Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)
1、eQTL、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析屬于Post-GWAS的一項(xiàng)重要工作，旨在GWAS結(jié)果的基礎(chǔ)上鑒定與表型相關(guān)的eQTL和mQTL位點(diǎn)。 傳...
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貝葉斯共定位軟件coloc前言 這篇文章的書寫，是受啟發(fā)于《post-GWAS：使用coloc進(jìn)行共定位分析(Colocalization)》，目的是想了解一下軟件coloc是如何巧妙的運(yùn)用貝葉斯方法...
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單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀002—COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas文章題目：COVID-19 immune features revealed by a large-scale singlecell transcriptome atlas ...
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單細(xì)胞文獻(xiàn)6-COVID-19患者的免疫反應(yīng)的單細(xì)胞景觀Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19 影響因子： 20.479...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)008--[sc]兩篇PBMC單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)034--[sc]急性川崎病外周血PBMC單細(xì)胞測序1. Study design and single-cell RNA pro!ling of PBMCs. 作者對(duì)采集了3例正常對(duì)照和7例川崎病患者給予IVIG治療前后的外...
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非腫瘤純生信：換個(gè)疾病又是一篇文章！全血和PBMC比較的思路今天給大家分享的是2019年Allergy Asthma Clin Immunol（IF=2.664）上的文章“Whole blood vs PBMC: compartmen...
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利用10X單細(xì)胞eQTL定位確定自身免疫性疾病的細(xì)胞類型特異性基因控制周二了，新的一周，雖然內(nèi)心一直想躺平，一直想回家，但是最終還是屈服，坐起來好好工作，不知道30歲一事無成算不算就是失敗的人生，人是不是總是在矛盾中前進(jìn)，也不知道前面有什么，或...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組高級(jí)分析進(jìn)階版作者，Evil Genius 單細(xì)胞研究已經(jīng)非常多了，空轉(zhuǎn)么，做的人也是相當(dāng)?shù)纳?，但是空轉(zhuǎn)也有很多的個(gè)性化分析，培訓(xùn)的ppt放出來，大家隨意查看。 ppt涉及的空間個(gè)性化分...
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10X單細(xì)胞免疫圖譜分析匯總作者，Evil Genius~~ 新的一周，天氣變冷了，大家努力科研工作的同時(shí)，注意保暖，畢竟身體是革命的本錢。 相比較單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組，ATAC和VDJ的文章相對(duì)較少，當(dāng)然了，...
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人類口腔微生物組數(shù)據(jù)庫（eHOMD）簡介隨著人體微生物組項(xiàng)目的開展，對(duì)人體口 腔微生物組的研究也日漸增多，NIH牙顱頜面研究 所（national institute of dental and craniofac...
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GTEx數(shù)據(jù)庫GTEx項(xiàng)目對(duì)來自人體多個(gè)組合和器官的樣本，同時(shí)進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序和基因分型分析，構(gòu)建了一個(gè)組織特異性的基因表達(dá)和調(diào)控的數(shù)據(jù)庫：Genotype-Tissue Expressi...
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[GBD數(shù)據(jù)庫挖掘] 1.數(shù)據(jù)的下載與整合歡迎關(guān)注R語言數(shù)據(jù)分析指南 最近有觀眾老爺在做GBD數(shù)據(jù)庫挖掘問小編一些數(shù)據(jù)處理的問題，正好去年也寫過相關(guān)的代碼，既然觀眾老爺們有需求那么就寫一些文檔來介紹一下，數(shù)據(jù)代碼已經(jīng)...
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公眾號(hào) R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
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連鎖不平衡分?jǐn)?shù)回歸 LD score regression -LDSC
什么是LD score? SNP j的LD score可以被定義為該SNP與一定范圍內(nèi)其他SNP的r2之和。 LD score 衡量了該SNP標(biāo)記的遺傳變異性的大小。 為什么...
