學(xué)習(xí)小組Day3-楊咩咩

由于打開ubantu后,發(fā)現(xiàn)仍是自己之前的,所以再次登錄


重新登陸.png

這次不需要重新輸入,因?yàn)橹耙呀?jīng)成功,所以這次一下子就登陸了

將miniconda下載到服務(wù)器上

1.輸入命令 uname -a查看

查看.jpg

從這里我們可以看出服務(wù)器是64-bit(x86_64)
2.登陸服務(wù)器,進(jìn)入biosoft目錄
3.輸入如圖所示,安裝
安裝.png

安裝1.png

4.輸入source ~/.bashrc激活,輸入conda
conda.jpg

5.添加鏡像
鏡像.jpg

6.開始使用conda
(1) 查看當(dāng)前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表 conda list
conda list.png

(2)安裝軟件 conda install fastqc -y
install.jpg

(3)確認(rèn)fastqc軟件是否安裝成功
help.jpg

(4)卸載軟件 conda remove fastqc -y
rm失敗.jpg

再次輸入命令即可成功
rm.jpg

7.其他
①查看當(dāng)前conda有哪些環(huán)境,輸入conda info --envs,建立一個(gè)名叫rnaseq的conda環(huán)境,然后指定python版本是3,安裝軟件fastqc、trimmomatic
查看環(huán)境和創(chuàng)建.jpg

②再次查看一下我們的conda環(huán)境,conda info --envs ,多了一個(gè)rna-seq。但是發(fā)現(xiàn),默認(rèn)還是base。所以需要激活新的conda環(huán)境。
安裝新的conda環(huán)境.png

即可看到默認(rèn)編程了ran-seq

思維導(dǎo)圖:
Linux環(huán)境下的軟件安裝.png
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